橙黃乳菇遺傳多樣性分析
Genetic Diversity of Lactarius akahatsu from China and Thailand
【作者】 李河； 徐建平； 郭亮； 劉君昂； 周國英； 朱丹雪；
【Author】 LI He1,2,XU Jianping1,2,GUO liang2,LIU Jun’ang1,2,ZHOU Guoying1,2,ZHU Danxue2 1Key Laboratory for Non-wood Forest Cultivation and Conservation of the Ministry of Education; Central South University of Forestry and Technology;Changsha,Hunan 410004,China; 2College of Forestry,Central South University of Forestry and Technology,Changsha,Hunan 410004;China
【機構】 經濟林培育與保護教育部重點實驗室,中南林業科技大學； 中南林業科技大學林學院；
【摘要】 分析來自湖南省道縣(DX)、張家界市(ZJJ)、芷江縣(ZJ)、麻陽縣(MY)和貴州省玉屏縣(YP)以及泰國(TL)6個橙黃乳菇種群38個菌株的ITS-5.8S序列的遺傳結構和遺傳多樣性。所有的ITS-5.8SrDNA序列樣品共檢測到2個變異位點,堿基A、T、G、C的平均含量分別為22.5%、26.9%、22.7%和27.9%。根據序列的核苷酸變異共定義了3種單倍型,其中單倍型Hapolotype 3是湖南和貴州5個種群共享單倍型,Hapolotype 2為6個種群的共享單倍型。中國橙黃乳菇各地區種群的單倍型多樣性(haplotype diversity,HD)在0.21875～0.59375之間,表明橙黃乳菇種群具有較高的單倍型多樣性。遺傳分化指數(fixation index,FST)表明,不同地理種群間的遺傳分化較大。AMOVA分析顯示,種群間的遺傳變異占總變異的17%,種群內部變異占總變異的83%。Mantel測試顯示地理距離與種群的遺傳分化FST值之間線性關系顯著(P<0.05)。采用N-J法構建的分子系統樹表明,當與乳菇屬相近種進行比較時,湖南、貴州和泰國不同地區的所...
【關鍵詞】 橙黃乳菇； 地理種群； 遺傳多樣性； 遺傳分化； ITS-5.8S序列；
【文內圖片】
植黃乳菇種群間的遺傳分化FST
值橙黃乳菇群體的Mismatch分布
基于ITSs,ss序列的r{系統樹
【基金】 國家自然科學基金(編號:30972371)的部分研究內容
【分類號】S646