Polymorphism of SSR Markers Based on the Whole Genome Sequence of Lentinula edodes and Use in Strain Identification
【作者】 張丹； 巫萍； 章爐軍； 唐利華； 宋春艷； 尚曉冬； 鮑大鵬； 譚琦；
【Author】 ZHANG Dan 1,WU Ping 1,2,ZHANG Lujun 1,TANG Lihua 1,SONG Chunyan 1 SHANG Xiaodong 1 ,BAO Dapeng 1,TAN Qi 1(1 Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Key Laboratory of Edible Fungi Resources and Utilization(South),Ministry of Agriculture,P.R.China;National Engineering Research Center of Edible Fungi,National R&D Center for Edible Fungi Processing,Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding of Shanghai,Shanghai 201403,China : 2 College of Life Sciences,Nanjing Agricultural University,Nanjing,Jiangsu 210095,China)
【機構】 上海市農業科學院食用菌研究所,農業部南方食用菌資源利用重點實驗室,國家食用菌工程技術研究中心,國家食用菌加工技術研發分中心,上海市農業遺傳育種重點開放實驗室； 南京農業大學生命科學學院；
【摘要】 利用香菇(Lentinula edodes)全基因組序列信息開發的35個香菇SSR(simple sequence repeat)分子標記用于中國25個香菇品種的鑒定。所選SSR標記共檢測出174個條帶,各引物檢測到的條帶數量變化范圍為2～12。篩選出的7對SSR引物組合顯示了良好的品種特異性鑒定能力,可以有效地鑒定部分國審香菇品種。
【關鍵詞】 香菇； 全基因組序列； SSR； 品種鑒定；
【文內圖片】
圖１香菇１３５菌株單核體和轉錄組的ＳＳＲ標記分布Ｆｉｇ．１ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５
圖２香菇１３５菌株單核體和轉錄組的ｍｏｔｉｆ類型次數分布Ｆｉｇ．２ＤｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎｏｆＳＳＲｍｏｔｉｆｓｉｎｍｏｎｏｋａｒｙｏｎｓａｎｄｔｈｅｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅｏｆＬ．ｅｄｏｄｅｓ１３５
【基金】 上海市科委重點科技攻關項目(編號:10391900900);種業發展專項[編號:滬農科種字(2012)第6號]的部分研究內容~~
【分類號】S646.12