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          基于rDNA ITS序列對絨泡菌目黏菌系統發育的探討


          【發布日期】:2019-01-21  【來源】:菌物學報
          【作者】李倩 閆淑珍 陳雙林
          【機構】南京師范大學生命科學學院
          摘要:絨泡菌目Physarida是黏菌綱Myxogastria最大的一個目,對其系統發育關系的研究一直是根據形態特征。為了從分子水平探討絨泡菌目乃至黏菌綱的系統發育關系,以黏菌r DNA ITS通用引物對絨泡菌目5屬8種黏菌的r DNA ITS進行擴增和測序,結合Gen Bank中已有的黏菌r DNA ITS序列,利用貝葉斯推斷法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)構建系統發育樹。結果表明:絨泡菌目不同物種的r DNA ITS區在堿基組成和長度上差異明顯,長度為777–1 445bp,G+C mol%在53.4%–61.9%之間。絨泡菌目與發網菌目Stemonitida聚類為兩個明顯的分支,在絨泡菌目分支上,絨泡菌科Physaraceae和鈣皮菌科Didymiaceae各聚為一支,支持了形態學上以孢絲是否具有石灰質為依據區分這兩個科的觀點。由多份不同地理來源的鱗鈣皮菌Didymium squamulosum材料組成的鈣皮菌科又形成3個分支,證實了這個形態種是由地域來源廣泛、繁殖親和性各異和遺傳變異較大的不同生物種組成的復合體。
          基金:國家自然科學基金(31170014); 江蘇省高校自然科學研究重大項目(12KJA180004);
          關鍵詞:黏菌; 核糖體DNA內部轉錄間隔區; 分子進化; 最大似然法; 貝葉斯分析;
           
           
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