【作者】朱兆香 曾昭清 莊文穎
【機構】中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室吉林農業大學食藥用菌教育部工程研究中心
【摘要】木霉屬真菌是一類重要的生物資源,在工農業、環境保護等方面具有較高經濟價值,對其進行快速、準確的物種鑒定兼具理論意義和應用前景。以木霉屬35個概念清晰的種為材料,選擇I TS、rpb2和tef1作為候選基因序列,利用T axon Gap對231個序列片段進行分析,將種內與種間序列差異以及序列獲取難易程度作為評價指標,篩選該屬的補充條形碼片段。結果表明,r pb2具有適宜的種內與種間序列差異,其最小的種間差異(2.48%),大于最大種內差異(1.8%),種內、種間遺傳距離存在明顯的間隔區,并且該基因序列具有較高的P CR擴增與測序成功率(94.4%);I TS和t ef1基因序列的種內與種間序列差異之間存在交叉重疊。因此建議r pb2作為木霉屬的補充D NA條形碼序列。
【基金】Supported by the National Natural Science Foundation of China(No.31270073)； Ministry of Science and Technology of China for Fundamental Research(No.2013FY110400)；
【關鍵詞】種內與種間序列差異; PCR擴增與測序成功率; rpb2;