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          石斛內生炭角菌DNA提取方法優化及分子鑒定


          【發布日期】:2019-01-25  【來源】:菌物學報
          【作者】鐘志敏 賴小平 黃松 張桂芳
          【機構】廣州中醫藥大學中醫藥數理工程研究院 廣東省中藥新藥研發重點實驗室
          摘要:本文對石斛內生炭角菌DNA提取方法進行優化,并基于ITS序列及其ITS2二級結構對其進行分子鑒定。比較試劑盒法及不同濃度(2%、3%、4%)CTAB法的DNA提取效果并對CTAB法進行優化;進行ITS序列的擴增及ITS2二級結構的預測。結果表明:4%的CTAB提取效果最佳,優化的CTAB法大大縮短了DNA提取時間;ITS序列與炭角菌屬3個種的相似度均為99%,ITS2二級結構僅與Xylaria arbuscula的二級結構100%相似。本研究所優化的CTAB法能為后續相關研究提供便利;結合ITS序列及ITS2二級結構能對石斛內生炭角菌進行準確的分子鑒定。 
           
          基金:港澳臺科技合作專項項目(2014DFH30010); 廣東省應用型科技研發專項資金重點項目(2015B020234008)~~;
           
          關鍵詞:石斛; 炭角菌; 優化CTAB法; 菌種鑒定;
           
           
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