灰樹花常見的生理性病害有很多，下面簡單介紹其中的三種：
1、不能形成原基或原基形成很慢
①病狀：發菌階段，菌絲長滿袋數日后，表面菌絲細弱不見原基形成，菌袋表面形成干黃的厚菌皮，有黃色或棕色的液體，出菇階段，轉入仿生栽培后，60～70天不見原基出現。
②病因：主要病因是菌種過弱或嚴重老化，培養料質量過差、營養貧乏。后期培養室光線過暗、通風不良。菌袋在發菌室內停放的時間過長，室內空氣干燥，菌袋內含水量過高，棉塞過緊。菌袋轉入栽培管理的季節過早，平均氣溫低于20℃。覆蓋物過厚，超過1.5厘米。菌袋表面干枯老化形成較厚的菌皮面無原基。機械損傷嚴重，原有的原基嚴重受損。管理不當，塑料布蓋得過嚴，前期階段水分過大，覆蓋物粘滯，通風透氣不足。
③防治方法：選擇生長旺盛，抗逆性強的2～3代菌株，選擇適宜的培養料配方，如以栗木木屑和棉籽皮為主的配方。調整pH值為5.5～6.5。發菌室后期加大空氣濕度至60%左右。去掉部分遮光物，增強光照強度，每日增加通風2小時，降低室內溫度至20～24℃。對積有黃褐色液體的菌袋，倒控出袋內液體放于通風處。在80%以上菌袋出現原基時，立即轉入出菇栽培管理。 選擇最佳栽培時期，以4月至5月底進行栽培較好，覆蓋物厚度為1～1.5厘米：栽培時把菌袋表面干枯變黃的菌皮去掉；盡量減少機械損傷，保護原有原基；掌握全面技術進行綜合防治，在整個生產管理過程中嚴格各項技術指標進行操作，使其達到最佳出菇環境。
2、原基干枯或腐爛
①病狀：原基表面沒有無色透明的營養水珠，沒有灰白色的長生點，表面干燥，生長停滯、變黃、變軟、腐爛，或形成凸凹不平的老蚧皮樣。
②病因：水分不足，原基形成后空氣濕度不夠，表面失水干枯，通風不暢，二氧化碳濃度過高，抑制了原基的形成和分化，溫、濕差過大，光照強度大、時間長，原基受灼烤干枯死亡。
③防治方法：原基露出覆蓋物后，把小棚內的空氣相對濕度由原來的70%左右提高到85%以上，分化出小枝葉后提高到90%以上。原基階段要求每天噴2～3次霧狀水，盡量保護原基。相應調整通風孔的大小，并在早晚隨著噴水可進行全面通風各一小時，溫度控制在17～26℃以內，棚內溫度絕對不能超過30℃，超過就要向棚內外噴水，加大通風孔進行降溫。在整個出菇管理過程中都不能有強光直射，原基階段更為重要。原基沒分化以前用較弱的輻射光，原基開始分化以后用7分陰3分陽的散射光，保證原基和成菇表面的灰黑色或灰白色。
3、“小老菇”
①病狀：菇體過小，多為白色，生長相當遲緩，有的長出3～5個葉片，其邊緣、內側或背側形成很多縱行菌管層，葉片下垂增厚，邊鈍圓，呈現一種嚴重老化的現象，故稱為“小老菇”。這種現象在5～7月份高溫季節栽培時較多見。
②病因：高溫時節栽培，一般栽后3～7天呈現原基并迅速分化。這類菇體是從原有原基上分化而來，菇體生長較快，加快成熟。若營養供應不及時，通風不良，菇體缺氧，較早成熟菇采摘不及時，都會形成小老菇。
③防治方法：降低菇棚氣溫，加強通風，在保證正常的溫度、濕度、光照的基礎上，盡量延長通風時間和通風量。適時采摘，一般不論菇體大小，只要葉片的邊緣沒有了灰白色的生長點，葉片背側有一半以上面積有針尖大小的多孔層出現，葉片分化較完全，葉面吸水能力減弱，即可采摘。
