平菇栽培中一旦發生“大紐扣菇病”，很難根治，只能通過事先預防來防止病害的發生。如果發病，在菇房內初現“大紐扣菇病”后就應立即對發病菇袋進行隔離，并搬出菇房外采取后續治療措施，也可以有效防止病害的進一步蔓延和擴展。
預防“大紐扣菇病”主要有以下措施：
1.更換抗病力強的品種。實踐證明，在同一地區，同一地塊，反復種植同一品種，容易感病。
2.應選用新鮮無霉變的原材料，制包前先在太陽下暴曬2～3天，制包拌料應在水泥地或塑料薄膜上進行，不要直接接觸土壤，如果在泥地上操作，預先灑石灰粉消毒。同時此拌料的pH值應控制在9以上，消毒滅菌后pH值在7～8之間。
3.在菌種培養和出菇期間，保溫保濕的同時注意通風換氣，防止30℃以上80%以上的相對濕度，在保證平菇菌絲正常生長和出菇的情況下，不給雜菌適宜的生長條件，抑制它的發展和危害。
4.做好菇房的消毒工作。
（1）在發菌期間，地面灑石灰粉，每隔7～10天檢查揀雜、且噴灑一次1%的石灰水，不但能有效滅菌，也能清除菇房的酸性物質，使菌絲生長粗壯，抗病能力強。 （2）出菇前對菇房的空間、墻壁噴灑一次1%石灰水。 （3）每采收一潮菇，向料面、空間、墻壁噴灑一次1%的石灰水，甚至可在第一潮菇結束補水時用1%的石灰清水（pH值在10左右）。 （4）出菇期間，及時清理菇腳，消除隱患。 （5）出菇后的廢料要及時清除，遠離菇房，并用石灰水噴刷、硫磺點燃熏蒸等方法及時對菇房消毒滅菌。 5.平菇大部分采用的是墻式立體覆土，該法易管理，產量高，補水方便，但缺點是不易散溫，容易燒菌，因土壤中自身也帶有病菌，極易發生該病。最好采取不覆土、單行排放、兩頭出菇的方法，層與層之間要用小竹竿等隔開，袋與袋之間要留一定間隙，以利于降溫。如果采取覆土出菇，也要注意對土壤嚴格滅菌；要覆混有稻殼、麥秸之類的混合濕土，既能保濕又有一定的通透性；既能滿足平菇生長所需氧氣，又能及時排出廢氣。
