出芝階段的管理
當菌絲長滿料袋后，用刀片把兩端割成5角硬幣大小的圓形口，以利出芝。出芝時棚溫保持在26~30℃，空氣相對濕度提高到90%~95%，并提供散射光和充足氧氣，保持地面存有淺水層，每天上午8時前及下午4時后打開門及通風口換氣，氣溫低時中午12時通風換氣。原基膨大3~5天，逐漸形成菌蓋時，增加噴水保濕，氣溫過高時噴水保濕。通風不良易出現畸形靈芝，當出現畸芽時要及時割掉。菌蓋逐漸由白色轉淺黃色，由黃色轉為紅褐色，菌蓋邊緣白色基本消失，邊緣變紅，菌蓋開始革質化，背面彈射出紅褐色的霧狀孢子時，表明靈芝子實體已成熟，應及時采收。從割口到采收需40~45天。
采收
靈芝采收前1周停止噴水，關閉通風門口，通道地面鋪上塑料薄膜，以便收集散發的孢子粉。孢子散發后，菌蓋由軟變硬，沒有淺白色邊緣，顏色由淡黃色轉變為紅褐色，不再生長增厚時，即可采收成熟的靈芝。采收靈芝時從柄基部用剪刀切除或用手輕摘，采收后及時陰干，有條件的烘干或曬干至含水量為12%，即為靈芝成品，裝袋，置于干燥的室內保存或出售。成品以身干、菌蓋肥厚、菌柄粗壯、質堅硬、色紅褐、具漆樣光澤者為佳。
注意事項
春芝的管理
3~6月產出的靈芝叫春芝。這一階段調濕是關鍵，要適時進行菌棒浸水。浸水前先用8號鐵鏟從菌棒的一頭穿到另一頭，然后把菌棒排放與水槽或水溝中，以淹沒菌棒為宜。注意：菌棒減量不到五分之一暫時不浸，溫度超過25℃以上暫時不浸。
秋芝的管理
11~12月產出的靈芝叫秋芝。其管理要點：溫度保持12~15℃，空氣響度濕度保持85%~90%。在空氣新鮮的情況下，減少水分蒸發，做好保濕工作。當芝蕾長到黃豆大小時，視天氣情況噴水。氣溫高于20℃時早晚噴，中午不噴；雨雪天不噴；陰天少噴。
冬芝的管理
1~2月產出的靈芝叫冬芝，其質量最好。此時芝房內溫度不要低于3℃。早晚不宜開窗，中午氣溫高時，適當開窗通風換氣。
