歐盟對轉基因生物環境釋放的現行審批程序根據歐盟90／220／EEC指令和2002年10月生效的歐盟2001／18／EC指令，如果某個公司打算將一種轉基因生物投放市場，該公司必須首先向該轉基因生物將要首次上市所在地的成員國有法定資格的國家管理機構提出申請。對于試驗性釋放，所在地成員國的國家管理機構也必須事先進行檢查和審批。
申請書必須附帶全面的風險評估報告。如果某個成員國的國家管理機構同意某種轉基因生物投放市場，該成員國必須通過歐盟委員會通知其他成員國。如果其他成員國沒有反對意見，最早進行評價的國家管理機構才能正式批準那種轉基因生物投放市場。然后，該轉基因生物就可根據批準書中所規定的條件投放到整個歐盟市場。如果其他成員國提出反對意見，歐盟將做出最終決議。歐盟委員會將首先征求其下屬的科學委員會的意見，這些科學委員會都是由獨立的醫學、營養學、毒理學、生物學、化學或其他類似學科領域的著名科學家組成的。如果科學家們表示同意，歐盟委員會就向由來自各成員國的代表組成的法規委員會提出決議草案。如果法規委員會表示同意，歐盟委員會就正式通過這一決議。
2002年10月生效的歐盟2001／18／EC指令，進一步強化了現行的有關轉基因生物環境釋放風險評估和審批決策過程的規定。該指令特別規定，生產商在轉基因生物投放市場的各個階段必須向公眾透露相關信息，并且實施標簽制度和注明產品來源。
自從歐盟90／220／EEC指令于1991年10月生效以來，歐盟委員會共批準18種轉基因生物進行商業性釋放。但是，自從1998年10月以來，歐盟委員會就沒有再批準任何新的轉基因生物進行商業性釋放。目前，共有13種轉基因生物正在申請批準之中。
歐盟對轉基因食品、轉基因飼料等的審批程序基本上也是如此。
歐盟現行轉基因產品標簽法規歐盟承認消費者在選購產品時具有知情權。歐盟于1997年通過的“新型食品和新型食品成分管理規定”，要求對由轉基因生物制作的、或含有轉基因生物成分的食品實施標簽制度。
歐盟委員會于2000年1月通過的歐盟50／2000規定要求，對含有轉基因DNA或蛋白質的食品添加劑和調味品也必須實施標簽制度。
歐盟49／2000規定要求，凡是轉基因DNA或蛋白質含量超過1％的常規食品都必須實施標簽制度。
歐盟98／95／EC指令規定，轉基因種子必須實施標簽制度。
歐盟新的法規草案歐盟于2001年2月通過了歐盟2001／18／EC指令，該指令針對轉基因生物釋放問題提出了更加有效和透明的措施，以保護人類健康與環境。根據這一指令的原則，歐盟委員會2001年7月25日提出了兩個有關轉基因生物的法規草案，即“轉基因生物、轉基因產品來源追溯和標簽管理規定”和“轉基因食品與飼料管理規定”。這兩個規定要求建立一個統一的轉基因生物來源追溯體系，對轉基因飼料實施標簽制度，加強對轉基因食品標簽的管理措施，建立一個關于轉基因生物用于食品與飼料、轉基因生物環境釋放的精簡的審批程序。
來源追溯制度要求開發轉基因生物的公司或農戶明確告訴買主其產品是屬于轉基因性質的，并且提供特定的相關信息，以便該轉基因生物可以準確地加以識別。賣主還必須將買主情況登記在冊。
歐盟目前的法規只是要求對可以檢測出轉基因DNA或蛋白質含量的最終食品實施標簽，這實際上意味著經過精加工的轉基因產品（例如精煉油）無需實施標簽。新法規草案則要求，所有的轉基因食品、成分以及飼料，不管是否可以檢測出轉基因DNA或蛋白質的含量，都必須實施標簽制度，以便消費者自由選購。但是，喂養過轉基因飼料或服用過轉基因藥品的動物所產的肉、奶、蛋仍然無需實施標簽制度。
歐盟部長理事會已經結束對上述法規草案的審批程序，并于2003年7月正式批準了“食品與飼料來源追溯和標簽法”。該法規于2003年末正式生效。該法規規定，任何轉基因成分含量超過0．9％的食品和飼料都必須進行明確標識。以前無需進行標識的豆油目前也被列入其中。
