日前，中國科學院微生物研究所趙瑞琳課題組首次把真菌的演化時間應用于確定分類等級和分類系統重建工作中，制定了演化時間作為確定分類等級的一個新標準。她說：“在劃分單系類群的分類等級時，相同分類等級的演化時間應大體一致；高分類等級的演化時間要早于低分類等級的原則。”相關論文已發表于真菌學領域的權威期刊。
趙瑞琳介紹了該研究思路首先在種類及進化支序繁多的蘑菇屬上應用，具體工作為：在700余世界各地樣品初步的系統發育分析的基礎上，以兩個傘菌綱化石標本為演化時間校訂點，通過多基因序列的分子鐘分析，確定蘑菇屬演化形成于6600萬年前；在3000萬年前形成6個單系支序（被命名為亞屬）；在2000萬年前左右，進一步分化出的22個單系支序（被命名為組）；而其他單系支序由于形成時間明顯晚于上述時間，不被劃分為任何一個種上分類單元，最終重建了蘑菇屬的世界性分類體系，解決了蘑菇屬內大量新進化分支的命名分類難點。
趙瑞琳說：“我們首先集結近十年來擔子菌門的最新進展，分別構建了擔子菌門6個基因的系統發育圖譜，及基于396個直系同源基因的系統發育圖譜。”
隨后的分子鐘分析表明擔子菌門演化形成于5.3億年前，擔子菌門中4個亞門的演化時間為4億~4.9億年前，對于具有大型子實體的傘菌綱的演化時間范圍分別為3.4億~3.9億年前，具有較小子實體的銹菌亞門和黑粉菌亞門中綱的演化時間范圍分別為2.4億~3.4億年前；擔子菌門中各個目的演化時間為1.2億~2.9億年前。
因此，趙瑞琳建議把這些演化時間作為建立擔子菌門中目及目以上分類等級的一個依據。借助于演化時間這一新標準，還新認定一個亞門Wallemiomycotina；發現1個目由于過于年輕的演化時間建議廢除；2個科由于具有的古老演化時間，分別正式提升為2個目。
趙瑞琳課題組的研究表明，演化時間可以成為劃分真菌分類等級的一個新標準，而且給出了擔子菌門劃分亞門、綱、亞綱和目的演化時間范圍標準。此研究方法為解決大量發現的新進化支序的合理分類問題，制定更客觀和穩定的分類系統提供新的依據，目前已在其他類群（如子囊菌門，表生真菌等）的系統學研究中采用。
