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          基于rDNAITS序列分析Alternaria與相似屬的關系及A.leucanthemi的分類地位


          【發布日期】:2018-03-27  【來源】:菌物學報
          【作者】趙國柱 張天宇 曹愛新 王洪凱
          【機構】山東農業大學植物病理學系 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統學重點實驗室 山東農業大學植物病理學系 山東泰安271018 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統學重點實驗室 北京100080
          【摘要】對Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五個形態相似屬的代表性種進行了5.8S/ITS區段序列測定,連同從GenBank下載的相關有性型Pleospora,Lewia的同項資料,由Neighbor-joining方法構建系統發育樹。序列對比結果顯示,所有參試的菌株/種的5.8SrDNA序列保守程度較高,ITS序列變化較大,ITS1比ITS2變化更大。由5.8S/ITS構建的系統發育樹可以足夠將供試菌區分到屬;系統發育樹顯示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系統學關系較近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相對較遠的分支上,與上述四屬關系較遠,相對獨立進化;有性型的Pleospora與無性型的Stemphylium被聚到一個分支,這種不同階段菌株在遺傳基礎上的一致,充分證明所用方法及所選測序的rDNA區段對本類群真菌的分類很有價值。Alternarialeucanthemi位于系統發育樹的外側,較為獨立進化,與Alternaria的其它種親緣關系較遠,卻與Stemphyliumspp.和Bipolarisspp.關系較近,對其目前的分類地位提出質疑。 
          【基金】國家自然科學基金項目(39899400); 中國科學院微生物研究所真菌地衣系統學重點實驗室(915)課題資助;
          【關鍵詞】鏈格孢屬; 匍柄霉屬; 假格孢屬; 埃里格孢屬; 細基格孢屬; 系統學;
           
           
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