【作者】蘇春麗 唐傳紅 張勁松 潘迎捷
【機構】南京農業大學生命科學學院微生物系上海農業科學院食用菌研究所上海水產大學食品科學學院 南京210095上海農業科學院食用菌研究所上海201106上海200090
【摘要】PCR分別擴增了38個靈芝屬菌株的β-微管蛋白基因片段,并對PCR產物進行序列測定,得到419bp的一段核苷酸系列。根據MEGA2.1軟件中的neighbour-joiningmethods對上述序列進行聚類分析,結果所有供試菌株被分成9個聚類組。中國栽培靈芝菌株分布于6個聚類組,其中樹舌亞屬、紫芝組的菌株各自聚成一組,靈芝組的菌株分成四組,但大部分靈芝組菌株均聚于同一組,這表明樹舌亞屬、紫芝組和靈芝組間的遺傳差異較大,靈芝組內雖然存在著一定的遺傳差異,但總體上親緣關系比較近,遺傳多樣性并不豐富。同時,序列分析的結果顯示,β-tubulin基因序列在第三位密碼子和內含子部位有高的堿基替換率,這些變異提供了豐富的系統發育信息,提示β-tubulin基因適合于靈芝屬菌株的親緣關系研究。
【基金】上海市農委重點攻關項目(No.農科攻字2002-1-4-3)；
【關鍵詞】序列分析; neighbour-joiningmethods; 聚類分析; 遺傳多樣性;