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          基于流式細胞技術的靈芝基因組大小估測


          【發布日期】:2019-01-18  【來源】:菌物學報
          【作者】李秋實 徐江 朱英杰 孫超 宋經元 陳士林
          【機構】中國醫學科學院北京協和醫學院藥用植物研究所瀕危藥材繁育國家工程實驗室
          【摘要】以藥典規定的靈芝正品來源靈芝Ganoderma lucidum作為研究對象,利用已完成全基因組測序的黑曲霉Aspergillus niger作為內標,通過機械破碎菌絲體的方法獲得合適濃度的細胞核懸液,碘化丙啶熒光染色后成功應用流式細胞術進行基因組大小估測。經過優化材料培養、樣品制備、上機分析等實驗條件,估測得出靈芝基因組大小(48.98±0.60)Mb,為靈芝基因組學研究提供重要數據。該方法簡捷穩定,在蕈菌范圍內,首次得到了全基因組測序數據與光學圖譜結果驗證,為蕈菌基因組學研究提供重要技術平臺。 
          【基金】國家自然科學基金重點項目(No.81130069); 國家科技支撐計劃(No.2012BAI29B01); 教育部長江學者和創新團隊發展計劃(No.IRT1150);
          【關鍵詞】DNA含量; 熒光染色; 蕈菌;
           
           
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