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          基于多基因序列分析對尖孢鐮孢菌古巴?;?香蕉枯萎病菌)生理小種的鑒定


          【發布日期】:2019-01-22  【來源】:菌物學報
          【作者】曾莉莎 呂順 劉文清 趙志慧 王芳 周建坤 李洪波 陳石 杜彩嫻
          【機構】廣東省東莞市香蕉蔬菜研究所大連民族學院環境與資源學院
          【摘要】由尖孢鐮孢菌古巴?;虵usarium oxysporum f.sp.cubense,Foc引起的香蕉枯萎病是香蕉生產上的毀滅性病害,自1996年以來已對我國華南地區香蕉生產造成了嚴重危害。傳統上香蕉枯萎病菌生理小種的鑒定主要采用人工接種鑒別寄主爾后測定病菌致病性的方法,但實驗周期長,且受季節影響。以來自澳大利亞的香蕉枯萎病菌生理小種1號(BW1)、2號(Race 2)、3號(Race 3)以及亞熱帶4號(BW4)為對照,對分離自我國華南地區主要香蕉產區(廣東、廣西、海南、福建等省區)的14株香蕉枯萎病菌的單孢菌株進行致病性測定,并結合熱帶4號小種(TR4)和亞熱帶4號小種(ST4)的分子特異檢測方法,確定其生理小種類型;同時,利用ITS、TEF‐1α、IGS、histone H3、β‐tubulin等5個主要用于鐮孢菌系統發育學研究的基因,研究不同地區不同來源的Foc菌株之間的親緣關系及其與非病原尖孢鐮孢菌的關系,并評價這5個基因在香蕉枯萎病菌生理小種鑒定上的應用價值。研究結果表明:(1)來源于我國華南地區的4號小種主要為熱帶4號小種;(2)TEF‐1α、IGS、histone H3等3個基因片段能夠將Foc中不同生理小種的菌株劃分成不同的系統發育譜系,與致病性測定的結果具有對應關系,也能較好地反映尖孢鐮孢菌種內菌株的親緣關系,可用于香蕉枯萎病菌生理小種鑒定;(3)我國Foc 1號生理小種的遺傳多樣性高于4號生理小種,Foc 1號生理小種的菌系與來自香蕉果實上的非病原尖孢鐮孢菌的親緣關系比其與Foc 4號生理小種的菌系的親緣關系更近。
          【基金】國家自然科學基金(No.30900003); “948”計劃(No.2011‐G16); 廣東省科技計劃項目(No.2011B020410004,No.2012B020410005); 東莞市高等院校、科研機構科技計劃項目(No.2011108101014);
          【關鍵詞】尖孢鐮孢古巴?;? 生理小種; 翻譯延伸因子; 基因內間隔區; 組蛋白H3;
           
           
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