【作者】王玉臣譚玉梅陳麗劉建魁劉永翔劉作易
【機構】貴州省生物技術研究所貴州省農業生物技術重點實驗室貴州師范大學生命科學學院貴州省農業科學院
【摘要】本研究以赤散囊菌Eurotium rubrum全基因組序列為對象,利用HMMER軟件構建隱馬爾可夫模型(hidden markov models,HMM)結合BLAST的方法鑒定了促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)超家族。通過構建系統發育樹對鑒定蛋白進行分析,并利用MEME軟件進行了保守性基序的預測及活性位點注釋。分析結果表明,赤散囊菌基因組包含了4個MAPK蛋白,分別屬于Hog1-type、Mpk C-type、Slt2-type和Fus3/Kss1-type類型;3個MAPK kinase(MAPKK)蛋白,分別屬于MKK1-type、Pbs2-type和Ste7-type類型;3個MAPK kinase kinase(MAPKKK)蛋白,分別屬于BCK1-type、Ste11-type和Ssk22-type類型。保守性基序分析及注釋結果表明,MAPKs超家族蛋白都包含了蛋白激酶活性位點"-D[L/I/V]K-"以及保守性的ATP-binding標簽序列。MAPK與MAPKK蛋白分別包含了"-Tx Y-"和"-SD[I/V]WS-"磷酸化位點,且MAPK蛋白還包含一個保守性的common docking基序(CD motif),而MAPKKK蛋白則包含了一個功能不明的保守性基序,其一致性序列為"-GTPYWMAPEV-"。研究結果為揭示MAPKs信號途徑在赤散囊菌中參與調控的生物學過程奠定了基礎。
【基金】貴州省科學技術基金(黔科合LH字[2014]7693,[2014]7688)； 黔農科院自主創新專項([2014]004,[2011]037)~~；
【關鍵詞】赤散囊菌; 促分裂原活化蛋白激酶(MAPK); MAPK激酶(MAPKK); MAPK激酶激酶(MAPKKK);