【作者】唐利華鮑大鵬萬佳寧李燕王瑩譚琦
【機構】國家食用菌工程技術研究中心農業部應用真菌資源與利用重點開放實驗室上海市農業遺傳育種重點開放實驗室上海市農業科學院食用菌研究所
【摘要】轉錄因子在真菌環境響應及生理過程中發揮重要的調節作用。本文利用轉錄組測序(RNA-Seq)技術研究光誘導香菇菌絲轉色過程中的轉錄因子表達變化。轉錄組測序結果表明,在光照條件下轉色的菌絲(313C)與黑暗條件下未轉色的菌絲(313W)相比,香菇菌絲中共有68個轉錄因子基因表達發生變化(48個轉錄因子上調表達,20個轉錄因子下調表達);轉色的菌絲(313C)與初始未轉色的菌絲(118)相比,香菇菌絲中有80個轉錄因子基因表達發生變化(49個轉錄因子上調表達,31個轉錄因子下調表達)。這些差異表達的轉錄因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族。另外,樣品的兩兩比較中差異表達的轉錄因子既存在部分重疊,也表現特異性。其中,313C/313W中有14個特異性差異表達轉錄因子,313C/118中有26個特異差異表達的轉錄因子。重疊的轉錄因子有64個,其中有39個表達水平上調,15個表達水平下調。采用實時熒光定量PCR對幾個轉錄因子進行了表達檢測,其中部分轉錄因子的表達趨勢與轉錄組分析基本相同。這些數據為進一步研究香菇轉色的轉錄調控奠定了一定的基礎。
【基金】上海市市級農口系統青年人才成長計劃[滬農青字(2015)第1-9號]； 國家自然科學基金(31170098)； 上海市科委崇明專項(13391912202)~~；
【關鍵詞】香菇; 轉色; 光線; 轉錄因子; 高通量測序;