食用菌是可供人類食用的大型真菌,在中國具有悠久的食用和栽培歷史；目前國際市場對食用菌的需求正不斷上升，近幾年食用菌每年的產值達250-280億元，食用菌產業被認為是21世紀的朝陽產業。
我國是許多食用菌的發源地，在國際食用菌生產中占據相當重要的地位，目前中國報道的食用菌有720多種。2004年中國食用菌產量達到1160萬噸，產量占世界總產量的70%。出口量占全球食用菌貿易量的40%，據海關統計，2004年我國出口食用菌58萬噸，創匯額9億美元。食用菌已經成為農民創收、發展農村經濟，建設社會主義新農村的重要產業；食用菌產業對豐富人民物質生活水平，提高人類健康具有重要意義。
雖然我國是食用菌生產大國和出口大國，但食用菌的專利保護問題卻長期未得到應有的重視，食用菌企業和科研機構知識產權保護不足的問題已成為制約我國食用菌產業發展的關鍵問題。長期以來，食用菌科研機構研究開發的新品種和新工藝不經專利保護就進入了生產領域，由于食用菌菌種及其生產工藝的可復制性，科技成果一經投入就遍地開花，科研機構無法實現科技成果的合理收益，導致我國食用菌科研機構嚴重萎縮，食用菌科研開發工作停滯不前；由于國內食用菌企業自身科技開發能力不足，又缺乏科研機構的技術支持，從而導致國內食用菌產業自主知識產權技術和品牌嚴重缺乏，，我國食用菌產業的發展也在低水平徘徊，食用菌產業的可持續發展難以為繼。
我國食用菌產業在國內缺乏知識產權保護的同時，在國外的知識產權保護更是一片空白；由于國外知識產權保護的缺位，近年來我國食用菌出口頻繁遭遇日本的食用菌專利保護壁壘；日本于2004年日本開始實施《種苗法修正案》，該法案規定：未經繳納專利費，擅自利用日本植物種源生產或改良的農產品的，個人侵權者會被處以300萬日元以下的罰金或３年以下有期徒刑；法人企業侵權的，可最高處以１億日元的罰金。據悉，截至2002年底，日本已經公布實施保護的食用菌有22類，通過注冊保護的品種有145個?；谏鲜鲆蛩?，所有利用日本種源的產品都要被加收專利費，食用菌出口日本將受到嚴重沖擊。此外美國和西歐國家也分別通過了保護食用菌在內的專利制度。這些規定將極大的影響我國食用菌產品的出口創匯，不利于我國食用菌產業的健康發展。
我國食用菌的知識產權保護目前仍存在植物新品種和專利保護兩個體系。目前我國農業部對食用菌菌種管理仍采用的“食用菌菌種管理辦法”，對食用菌依照植物新品種保護條例實施保護，然而到目前為止，我國保護的食用菌新品種只有阿魏側耳一種。但從分類學角度出發，食用菌屬于微生物中的真菌，不屬于植物品種，國家專利局應對食用菌從微生物菌種角度來保護。
隨著分子生物學技術的發展，rDNA測序技術已經可以實現食用菌種源的分類鑒定，國內已經開展了冬蟲夏草真菌的分子生物鑒定工作并取得了良好結果。因此依托合理的技術策略完全可以實現食用菌種源的知識產權法律保護，這對于發展具有自主知識產權的我國食用菌產業發展具有非常重要的現實意義。
