一、黃腐病
1、癥狀
子實體初期易出現黃褐斑病，隨后擴展到整個菇體，菇體停止生長，最后變黃、變軟、腐爛。這是由細菌類假單胞桿菌引起的病害。
2、發生原因
高溫(20℃以上)、高濕、通風不良時極易發生。主要是通過水來傳染，當子實體含水量過高時易發生。
3、防治方法
①在出菇期間，當溫度高于18℃時，切勿向子實體噴水，只能向地面和四周墻壁上噴水來增加濕度。
②出菇期間，要加強通風換氣管理，避免出現高溫、高濕環境。每次噴水后，結合進行通風換氣管理，降低菇體表面上水分，可防止細菌性病害。
③出現病害后，及時摘除病菇，加強通風換氣管理，防止傳染其他菇體。
二、枯萎病
1、癥狀
杏鮑菇幼菇生長停止，萎縮死亡，最后變黃、腐爛。出現這種現象，主要是高溫(22℃以上)引起幼菇 死亡，最后出現細菌感染，變黃并腐爛。
2、防治方法
發生條件子實體生長期間，將溫度控制在10—20℃之間，最高溫度不得超過22℃。高溫時采取降溫措施。幼菇枯萎死亡后，及時摘除，防止細菌繁殖，菇體腐爛，引誘害蟲取食繁殖，出現蟲害。
三、畸形菇
1、癥狀
子實體長成不規范形狀，即為畸形菇，從而降低商品價值。
2、發生原因
子實體生長期間，遇到22℃以上高溫，抑制了菌蓋分化和發育。此外，空氣相對濕度低于70％時，也易長成畸形菇。
3、防治方法
合理安排出菇季節，將出菇溫度控制在13—20℃之間，避免在20℃以上出菇。子實體生長期間菇房內空氣相對濕度保持在80—90％之間，滿足子實體生長發育所需水分條件。適時開口出菇，加強通風換氣管理，保持菇房內空氣新鮮，避免二氧化碳濃度過高。
另外，出菇時菌絲旺長子實體萎縮或黃化死亡這是菇棚內溫度突然升高所致。在出菇階段，菌絲、子實體都在生長。在正常情況下，這兩種生長達到動態平衡。決定這一平衡的關鍵因素是溫度。相對較高的溫度有利于菌絲生長，而相對較低的溫度有利于原基的分化。突然升溫，打破了原有的平衡，使營養生長即菌絲生長占了優勢。在營養、水分一定的情況，供給菌絲生長的營養、水分多，供給子實體的營養、水分就少了，嚴重時子實體營養倒流，在外觀上表現出子實體萎縮，甚至枯黃死亡。
