金針菇料內含水量的多少與產量、質量的高低是成正比關系的。因此，在出菇期改變常規的管理辦法，適時加強水肥管理，可取得理想的效果。而金針菇與平菇等栽培管理是不同的，因為出菇期不宜直接向子實體和料內噴水，所以采收菇后培養料內嚴重缺水，會很難再出菇，很多菇農因此放棄管理，導致產量偏低。所以，水療養是一個重要舉措。
一、保水。菌絲發到袋底后，立即開袋搔菌，耙去老菌皮，蓋濕報紙或地膜進行保濕催蕾。報紙覆蓋的，噴水應少量多次每天3——4次，以保持報紙濕潤；地膜蓋的，可向地面和空間噴水，保持空氣濕度90％左右。此期每天開窗通風1次，室溫控制在10——14℃，經5——7天菇蕾便大量發生。
二、噴水。當金針菇子實體長到3——4厘米，進入伸長期后，每天噴水4——5次。噴水量隨菇的長大而增加，掌握空氣濕度在90％左右（即子實體基部袋壁附有細水珠為宜），促進子實體迅速生長。同時適當通風，采取干濕交替來抑制菇蓋增加和促進菇柄伸長。此階段噴水量應根據天氣而定，晴天多噴，雨天少噴，以防因用水過量而發生根腐病、褐斑病和菇體含水過多而降低品質。切忌將水噴灑到菇蓋上，發現報紙破損要及時更換，報紙上有積水要立即倒掉，防止菇體接觸水滴產生黑斑點，影響商品外觀。
三、補水。菌袋在頭潮菇采收后，含水量下降20％——30％，二潮菇采后下降30％—50％。因此，在第一、二潮菇采收后，要立即向菌袋里注水補濕。棚栽的金針菇一般在采完一茬菇后即可進行補水。其做法是：直接向袋中注射營養水，注水量的多少以采菇量為準，即出完多少菇就補多少水，不可使袋內積水。營養水的配方可以參考平菇營養液的配比。
