一、黑木耳發菌期
在接種之前，第一步，要建好發菌室，發菌室要建立在交通便利、水源方便、空氣清新的地方。針對冬季寒冷的北方，發菌室內需要有增溫設施。
發菌室內需要搭設培養架，培養架寬1.2m-1.5m，長度不限。為了避免上下溫差太大，培養架一般安裝6-7層，層間距35cm左右?？稍诖布苤胁堪惭b軸流風扇，使室內溫度循環起來，達到上中下層溫度基本一致的目的。
發菌中期同時控制空氣相對濕度為55%-65%。光照上仍然采取暗光管理。
二、裝袋
栽培黑木耳需要用聚丙乙烯材料做成的菌袋，可耐高溫，規格可用菌袋周長17cm，高度30-33cm。裝菌袋之前需要調整好機器，確保菌袋裝的緊實，如果菌袋和栽培料之間有空隙，將來子實體有可能生長在這些空隙里。裝菌袋時，確保栽培料的裝入高度為18-20cm，如果低于18cm就會增加生產成本，如果高于20cm，發菌時間延長，容易造成菌絲老化。菌袋裝好后，把袋子的袋口收緊，套上套環，并塞上棉塞，然后輕輕地放入周轉箱內，以備滅菌。
三、菌袋滅菌
只有滅菌徹底的菌袋，接種后的菌絲才能生長，如果滅菌不徹底，將來會收到雜菌的影響，影響黑木耳的產量與品質。采用常壓滅菌箱進行滅菌，溫度為108-130攝氏度，持續8h。滅菌時間要從菌袋內溫度達到100攝氏度開始計算，滅菌時間滿8h之后，關閉滅菌箱，再燜制3-5h，等到自然冷卻后，再取出周轉箱。
四、接種
木耳栽培種接到栽培料上，經過滅菌的菌袋要冷卻到25-30攝氏度時才能夠進行接種。由于黑木耳抗雜菌的能力較弱，所以在接種時要凈化生產環境，為了方便接種，可以用薄膜搭建臨時的方便的接種室。操作人員接種前，需要先用酒精燈對接種鉗進行消毒，取出菌種后，立刻打開菌蓋上的棉塞，把菌種塞入菌袋，整個接種的動作一定要快，放進菌種后，立刻用棉塞封住菌袋，以免雜菌進入，栽培種的接種量為2-3g左右。
五、發菌
發菌是指菌絲體在栽培料中生長擴散的過程，擺放菌袋時，菌袋的堆放高度為5-8層，如果堆放過高，菌袋內的溫度過高，會造成高溫燒菌等現象。發菌期間，一定要做好溫度、濕度、光照、通風等管理工作。發菌前期，發菌室的溫度應當適當低一些，設置在20-22攝氏度為宜。如此，可使得剛接種的菌絲慢慢地恢復生長，菌絲粗壯有生命力能夠減少雜菌的污染。
控制空氣相對濕度為55%-65%，如果空氣相對濕度低于50%，可向地面噴水，增加空氣濕度，如果高于65%，要適當通風，降低濕度。黑木耳發菌前期無需光線，整個發菌室用深色厚布簾覆蓋，要求達到暗光培育，寧黑勿亮。
黑木耳發菌中期，這段時間菌絲生長速度非?？?，菌袋內會產生熱量，如果熱量散發不出去，就容易產生燒菌的現象。此外，菌絲生長過程中需要大量氧氣，如果氧氣不足，菌絲會停止生長，控制溫度為25攝氏度左右，保持溫度的穩定，避免忽冷忽熱。
發菌中期：做好通風管理，每天早晚兩次通風，每次20min左右，從而保證菌絲快速生長期間，發菌室內空氣清晰，氧氣充足。發菌中期要經常檢查菌袋，發現有雜菌污染的菌袋要及時處理。
由于發菌室的溫度和濕度較高，因此，每隔7d左右需要消毒一次，消毒藥劑可以選用次氯酸鈉。另外，可以選用二氯異氰尿酸鈉藥劑進行清蒸消毒。在發菌室里布置好清蒸消毒劑，然后依次點燃，封閉發菌室，進行消毒。
在適宜環境下，接種后20d左右，菌絲就能長到菌袋的1/3，接種后40d左右，菌絲就能長到菌袋的4/5，即進入發菌后期的管理階段。此時，需要將發菌室的溫度降到18℃-22℃，因為菌絲在較低的溫度下生長的健壯，營養分解，吸收充分。這樣的菌袋出耳早、分化塊、抗病力強、差量高。
在黑木耳栽培種發菌后期，還不能移出發菌室，即使菌絲長滿菌袋，還需要等到出耳的有效基溫，才能進行出耳操作。在適宜條件下，中熟品種在菌絲長滿菌袋20-40d后，還要在菌室內培養一段時間。
發菌后期：發菌室濕度控制在60%左右，仍然采用暗光管理，同時增加通風的時間和次數，保證發菌室內空氣新鮮。然后對菌袋進行割口處理，每個菌袋上均勻地割口12個左右，長約3cm左右，割口的大小和形狀決定了黑木耳的生長形狀。這種割口方式，割出來的木耳比較大，產量比較高?；蛘呤褂脤Ｓ酶羁跈C，每個口的長度是0.5cm左右，每個菌袋上均勻分布200多個口。這種隔口方式長出來的木耳大小均勻，小巧玲瓏。這種方式產出的黑木耳產量會低一些，但是價格比大黑木耳高。
割完口之后進行消毒，使用5%的甲酚皂1000倍液對菌袋進行噴霧消毒。當菌袋割口之后，需要等待4-5d才能進行下一步操作，此時要用草簾覆蓋，讓菌袋恢復。
等到菌袋重新緊實之后，在菌袋下方鋪上帶孔薄膜，并將菌袋頭朝下，倒立擺放，利于菌袋吸收水分。菌袋之間的間隙應保持在20cmx20cm。在黑木耳的耳基形成期，同樣需要覆蓋一層草簾，讓菌袋接受均勻的散射光，經過10d左右的培養，會長出黑木耳原基，原基長滿后，基形成期即宣告結束。
六、子實體分化期的管理
子實體分化期床面空氣濕度保持在90%左右。如果濕度不夠，耳基容易失水僵化，影響耳片的分化；濕度過大，會造成耳基腐爛。木耳雖然喜水，但不能浸泡在水中，一定要避免內澇。
七、生長期管理階段
從黑木耳耳片展開到1cm左右，便進行生長期，這段時間，床面的空氣相對濕度保持在90%-95%左右，在這個時期，一定要保證好水的管理，需要干濕交替管理，干要干透，濕要濕透。噴水時間在晚上溫度低時噴水，澆水時間最開始保持在5-10分鐘，停止7-8分鐘，間隔再噴水，再次噴水的時間需持續達到15-20分鐘。
從給菌袋割口到成熟，大約30d左右，采摘時用手指捏住黑木耳，用手輕輕往下一拽即可。采摘后的黑木耳要馬上進行晾曬，等待其水費含量低于11%，就能收裝了。
