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枝條菌種比傳統的木屑菌種更具有制作技術簡單、成本低廉、感染率低、菌棒發育良好、耐老化等優點。枝條菌種技術還可廣泛應用在平菇、白靈菇等菇類菌種制作上，效果一樣好?，F將枝條香菇菌種的制作程序與方法介紹如下：
選材備料
制作菌種可選用的枝條有紫穗槐條、荊條、竹條及櫟木枝條等，但以紫穗槐條為最佳。以紫穗槐條為例，枝條砍伐宜在秋冬季節，這時枝條葉子落盡，含養分比較高，便于以后浸泡復水。應選用枝體細長均勻、直徑約１厘米的枝條，除去雜枝殘葉后用切條機把枝條切成長約２．５厘米的小段，枝條與刀不要垂直，使切口呈斜長形，以便于插入香菇棒接種。將切好后的枝條曬干放在編織袋中，扎口貯藏于通風干燥處，以備制種時使用。應經常檢查是否發生霉變，如發生霉變應及時開袋晾曬。
枝條菌種制作
1、浸泡枝條
把干枝條倒入池中，干枝條量約占池容積的2／3，然后用木板壓蓋枝條，上用重物壓實，加清水至池滿。浸泡約36個小時后檢查枝條是否泡透。用錘子把浸泡后的枝條砸開，看其心中有沒有干白碴，如有應繼續浸泡，如無說明已泡透。去掉壓覆物后加入少許生石灰攪勻以調節酸堿度，然后用竹筐將枝條撈出，瀝水裝袋。
2、裝袋滅菌
可選用15厘米×35厘米的專用聚丙烯菌種袋，每個菌袋內裝枝條90－100段。為杜絕感染，在菌袋外再加套一層菌袋。裝滿后把菌袋口縱向折疊后再折彎，用橡皮筋或塑料繩扎住，注意不要扎得太死，以免高溫滅菌時袋內空氣膨脹導致袋子被脹破。把菌種袋放到高壓鍋中保持2個氣壓高溫滅菌約2.5小時，出鍋冷卻至常溫等待接種。
接種與發菌培養
接種前將接種箱內清掃干凈，用氣霧劑滅菌30分鐘后開始接種。接種時應把木屑原種挑成玉米粒大小的塊狀，但不要太碎，這樣可使菌種更易于萌發。接種完畢后把菌種袋移入菌種空架上并排列整齊。春栽菌種在冬季制種，秋栽菌種在盛夏制種。室內溫度應保持在24－27℃，要避免忽冷忽熱，溫差過大會影響菌絲正常生長，造成發菌緩慢。當菌種袋發菌至1／3袋時，要全面檢查是否有雜菌，如有應及時揀出處理掉。發菌45天左右菌絲便可走滿全袋。
