一、改善生態環境
栽培房棚要選擇在近河流、空氣流暢、四周寬闊，遠離禽畜飼養場、釀造廠、生活區及醫院至少3000米以外；場地采取翻土、曬白、灌水等措施取代農藥進行消毒；水源水質清凈無污染，嚴禁污水噴菇、浸洗。
二、提倡生物防治
培養料配制可采用植物抑霉劑和植物農藥，如中藥材紫蘇、菊科植物除蟲菊、酯類農藥、木本油料植物菜籽餅等均可制成植物農藥殺蟲、治螨。還可以采用壯菇抑蟲，從菌種選育、培養料配比、堆料發酵、接種發菌、出菇管理各個環節嚴格把關入手，減少病蟲害，育壯菇體增強自身抗病抵害能力。此外，還可以采取特異性菇類輪作、間作，如竹蓀有一股濃香味，蚊蟲聞而生畏，采用菇、蓀交替輪作也有利防蟲。
三、實行物理防治
接種室、發菌室、超凈工作臺等，采用30瓦紫外線燈照射消毒殺菌；也可采用電子臭氧滅菌器消毒殺菌 栽培房采用黑光燈誘殺菇蚊、蠅、葉蟬等昆蟲。菇房(棚)門窗安裝防蟲網、紗窗等。
四、嚴格科學用藥
堅持以防為主，在確定需要使用化學農藥時，必須選用高效低毒、低殘留的藥劑。如敵百蟲、辛硫磷、克螨特、銳勁特、甲基托布津、甲霜靈等。用藥應在沒出菇或每批菇采收后進行，并注意少量、局部施用，防止擴大污染。嚴禁在長菇期噴灑農藥，禁止在菇類生產過程中使用甲胺磷、甲基1605、1059、久效磷、水胺硫磷、殺蟲脒、氧化樂果、毒殺酚等一切汞制農藥及其他高毒、高殘留農藥。
五、產品加工符合標準
食用菌產品常因加工過程引起含硫量超標，為此必須全面推廣精密度好的機械進行脫水烘干。菇品包裝必須符合國家衛生標準，即干食用菌衛生標準、鮮食用菌衛生標準及食品包裝衛生標準。
福建省食用菌學會 丁湖廣
