食用菌雜菌已達100余種，最常見和危害較嚴重的雜菌主要有要木霉、鏈孢霉、毛霉、曲霉、青霉、細菌等20多種?，F將主要幾種病害的癥狀及防控措施簡述如下：
一、木霉
木霉俗稱綠霉，幾乎能為害所有的食用菌，其對食用菌的為害表現為：污染培養料與食用菌爭奪營養和空間；分泌霉素殺傷、殺死寄主；木霉菌絲接觸到寄主菌絲時將寄主菌絲纏繞切斷。 采用的防治方法：
1、培養室、栽培場所應保持低溫，空氣相對濕度控制在 85%左右，并保持清潔衛生，通風良好。
2、一旦發生木霉為害，要立即通風降濕、菌筒感染初期，可采用2%醛溶液或 3-5%的石碳酸注射，抑制木霉的擴張。 部分感染成熟的菌筒可挖除污染部位，在處理部位上撒施石灰粉或石硫合劑或波爾多液等，也可用多菌靈，施保功，甲基托布津等殺菌劑防治。 如用50%多菌靈1000們拌料可預防木霉的發生，但不宜在猴頭、木耳、銀耳上使用多菌靈。
二、鏈孢霉
鏈孢霉俗稱紅粉病，紅面包霉病，為食用菌生產中常見雜菌，可污染所有的食用菌，是一種頑強、速生的氣生霉菌，培養料受污染后，還在料面迅速形成橙紅色或粉紅的霉層。 采用的防治措施：盡量避開悶熱，潮濕的夏季高溫期進行生產，注意搞好環境衛生。一旦出現桔紅色塊狀分生孢子團，用濕布或濕紙小心包好拿掉，浸入藥液中或深埋，切勿用噴霧器直接對病菌噴藥，以免孢子飛散；也可及時滴上適量的甲醛，煤油或柴油，然后用薄膜包扎，可使霉糜爛死亡。發菌后期受害，可將受害菌袋埋入深 30-40 厘米透氣差的土壤中， 經 10-20 天缺氧處理后，能減輕病害可出菇。多菌靈、施保功等殺菌劑可控制鏈孢霉的生長。
三、曲霉與青霉
曲霉俗稱黃霉、綠霉、黑霉等。 曲霉的種類很多。 黑曲霉的菌落為黑色疏松的果粒狀；黃曲霉黃色、黃綠色，最后呈褐綠色；灰綠曲霉初白色后呈灰綠色；青霉，其種類多、菌落呈灰綠色、黃綠色或藍色粉狀霉層。曲霉、青霉均屬常見的雜菌，它們與食用菌爭奪營養、水分，并分泌霉素抑制食用菌生產。采用的防治措施：加強培養室的通風、降低溫度，減少空氣相對濕度，局部發生可用 5-10%的石灰水沖洗 ，其它防治方法可參考木霉防治。
