猴頭菇病蟲害的防治，要采取以防為主、綜合防治的方針。
一旦發現為害，就要認真分析，判斷原因，采用農業防治、生態防治、生物防治、物理防治等各種措施，在各個栽培管理的技術環節上，杜絕或減少病蟲入侵的途徑和機會，創造一個有利于猴頭菇生長發育而不利于病菌、害蟲發生與繁殖的生態條件，將病蟲危害降到最低限度。
在確實需要用化學藥劑防治時，只能使用低毒的，而且應在未出菇前或每潮菇采收后進行，并注意少量、局部施用，絕不能直接噴于菇體上，以免影響人體健康。
一：選用優良菌種
（1）：要使用種性好且高產、優質、抗逆性強的菌種。
（2）：對菌株的生物學特性要清楚，制種者、栽培者必須了解所用菌株的菌絲和子實體生長的適溫范圍、栽培要點、菇體形態特征、加工性狀等特怊。
（3）：菌絲長勢強，純度高，無病蟲感染。
（4）：菌齡適宜，嚴格淘汰老化、退化的菌種。
二：阻斷病蟲入侵途徑
（1）：培養料新鮮、無霉變，消毒滅菌要徹底。
（2）：搞好培養場所、出菇場所及周圍環境的衛生；栽培場所要遠離倉庫、飼養場、垃圾堆；廢料、料塊、舊菌袋不要堆在栽培場所附近，必須及時進行高溫堆肥或其他處理。
（3）：有條件的菇棚，要安裝紗門、紗窗以防止昆蟲進入。
（4）：老菇棚在使用前必須進行一次全面的清理和消毒工作，以殺滅潛藏于床架、地面等處的病菌、害蟲，床架可用清水或5%石灰水或1% 漂白粉水沖洗，菇棚地面在使用前撒一層石灰粉。（5）：認真消毒和清潔各個操作環節中的工具、設備、環境及工作人員的服裝、手套等，防止在操作過程中將病菌、害蟲帶入培養料、培養室和菇棚中。
（6）：采菇后要徹底清理菌袋，把菇根、爛菇及被害菇蕾摘除干凈，集中深埋或燒掉，不要隨意扔放。每批菇栽培結束后，及時清除廢料，把栽培場所打掃干凈。
三：創造適合長菇的生態環境
在適宜條件下，猴頭菇生長發育正常，可大大減少病蟲發生的機會。特別要做好猴頭菇生長的溫度、濕度、光照、通風的控制，創造一個有利于猴頭菇生長的環境，促進猴頭菇正常生長發育，從而減少病蟲害的發生。
（1）：栽培場地要高燥、向陽、排水、通風，且水源方便，交通便利。
（2）：菇棚要通風良好，光照度適宜，保溫及保濕條件好、具有有效的防蟲、防鼠設施。
（3）：培養料質量優良、配合比例適宜，料袋的緊實度適宜。
（4）：選擇適宜的播種期，避開高溫或低溫影響。
（5）：及時防治病蟲害，當病蟲局部發生為害時，要及時采取行動，將其消滅在萌發狀態，防止擴散蔓延。
總結：以上是猴頭菇病蟲害的綜合防治措施，高產量的優質猴頭菇必須要做好病蟲防治。
