隨著農村生產力的發展，農民專業合作社作為一種新興的市場經營主體應運而生。對于培育和打造區域經濟的主導產業來說，農民專業合作社發揮了重要作用。
以許昌縣百珍食用菌合作社為例，它以河南世紀香食用菌開發有限公司為依托，采取“合作社+農戶+基地”的運行機制，發展社員263人，輻射帶動了許昌縣及周邊30多個食用菌生產專業村的5萬多戶種植戶，建成了13個年產千噸的無公害食用菌標準化生產基地，并形成了輻射全國26個省市、683家專業合作社及3.9萬戶種植戶的服務網絡。2008年1月，國務院副總理回良玉到該合作社的無公害食用菌標準化生產基地視察，高度贊揚合作社的運行機制，指出合作社實現了一產、二產、三產的有機結合。
這樣的例子還有很多。襄城縣恒源種植專業合作社積極帶領廣大社員種植白靈菇、雞腿菇等食用菌，建立了襄城縣第一個食用菌研究中心，目前發展社員445人，帶動農戶3132戶。禹州市興達畜牧飼養專業合作社聯結社員積極開展無公害生豬飼養，已擁有48家標準化飼養場，年出欄生豬5萬余頭，成為禹州市重要的飼養基地之一。
