梯棱羊肚菌線粒體基因組研究取得新進展

      華中農業大學植物科學技術學院邊銀丙教授領銜的羊肚菌課題組近日公布了梯棱羊肚菌線粒體物理圖譜繪制和進化分析結果，論文發表在International Journal of Biological Macromolecules上(IF=4.7)。這是該課題組在梯棱羊肚菌（Morchella importuna）研究領域兩年內發表的第4篇SCI論文。
      線粒體參與能量代謝、離子穩態、細胞衰老和凋亡等事件。真菌線粒體基因組通常僅14個保守基因，基因組大小在11 kb至235.8kb 。該研究顯示，梯陵羊肚菌線粒體基因組總長度272.2kp，這是迄今為止報道的最大的真菌線粒體基因組。除包含14個保守的線粒體編碼蛋白、2個核糖體大小亞基基因rRNA和32個tRNA外，還包含151個非保守線粒體ORF (ncORF)。保守蛋白、核糖體rRNA和tRNA總序列長度僅占基因組8.52%；ncORF總長度達89kb，占總長度的34%。令人意外的是，這些ncORF中108個基因在梯棱羊肚菌營養生長階段處于活躍表達狀態，暗示在梯棱羊肚菌線粒體基因組中可能具有某些特殊功能。
      梯陵羊肚菌超大的線粒體基因組中隱匿著大量散在重復序列，在10^-5的比對閾值下總計有2216個重復單元，重復序列的總長度占基因組大小的18.7%，部分較大的序列單元具有高拷貝的重復次數。這種高度重復的特征也導致線粒體組裝難度較大，課題組采用了一種迂回策略完成了de novo的組裝。
      該院羊肚菌課題組以博士生劉偉為核心成員，主要從事羊肚菌屬遺傳及營養生理研究，目前在國內外羊肚菌研究領域已經具有較大的影響力。
      論文銜接：https://doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2019.12.056