【作者】吳小梅張昕李南羿
【機構】浙江農林大學林業與生物技術學院浙江農林大學農業與食品科學學院
【摘要】雙孢蘑菇是世界第一大宗栽培食用菌,具有重要經濟價值。為探討雙孢蘑菇子實體不同發育時期基因表達變化,利用高通量測序技術對雙孢蘑菇原基期、采收期和開傘后期等不同發育時期進行RNA‐Seq分析,共篩選到6 328個差異表達基因,其中3 941個上調基因,2 387個下調基因。Gene ontology(GO)功能聚類分析表明,差異表達基因主要富集在結合、催化分子功能組和代謝過程生物學通路中,且發育過程和有性繁殖相關的基因全部為上調表達,以利于細胞分化發育形成成熟子實體進入生殖生長階段。KEGG功能富集分析結果表明,差異基因參與了氨基酸代謝、碳水化合物代謝、核苷酸代謝、脂類代謝和能量代謝這五大代謝通路,其中差異基因主要富集在氨基酸代謝通路中,氨基酸合成相關的多數基因上調表達,表明雙孢蘑菇子實體發育形成需要一系列代謝反應協同調控,氨基酸代謝相關基因可能在雙孢蘑菇子實體發育過程中起重要作用。本文通過全面分析雙孢蘑菇子實體發育時期基因表達變化,獲得了大量轉錄本信息,為深入了解雙孢蘑菇子實體發育調控分子機理和相關功能基因提供了重要的基因數據資源。
【基金】國家自然科學基金(31201668)； 浙江省農業新品種選育重大專項(2012C12911,2016C02057‐4)~~；
【關鍵詞】雙孢蘑菇; 高通量測序; 差異表達基因; 代謝途徑分析; 氨基酸代謝;