【作者】劉旭影 阮心眉 程凡升 李文香 朱丹
【機構】青島農業大學食品科學與工程學院 青島農業大學生命科學學院
摘要：以雙孢蘑菇(Agaricus bisporus)10448個蛋白為研究對象,綜合利用信號肽分析軟件SignalP 4.1、跨膜結構預測軟件TMHMM v2.0、GPI錨定位點預測軟件big-Pi Predictor以及亞細胞蛋白定位軟件TargetP1.1等生物信息學軟件,篩選雙孢蘑菇胞外分泌蛋白質序列,使用分析軟件BLAST2GO進行功能注釋。篩選得到469個胞外分泌蛋白質序列,統計發現編碼這些蛋白質的開放閱讀框(open reading frame,ORF)最長為4800bp,平均為1233bp。除去假定蛋白質,雙孢蘑菇胞外分泌蛋白質的生物代謝途徑主要有生物大分子代謝(22.2%)、碳水化合物代謝(17.4%)、脂質代謝(3.2%)、芳香化合物代謝(2.2%)等。同時,共發現133種酶類,其中包括糖苷水解酶(38.5%)、多銅氧化酶(7.4%)、肽酶(7.0%)、果膠裂解酶(4.0%)和羧酸酯酶(2.9%)等。
基金：國家自然基金(31301438和31501331)； 山東省優秀中青年科學家獎勵基金(BS2013SW034)； 山東省現代農業產業技術體系食用菌創新團隊建設專項基金(SDAIT-07-07)資助；
關鍵詞：雙孢蘑菇; 胞外蛋白; 生物信息學; 功能注釋; 酶學分類;