【作者】龔明 鮑大鵬 唐傳紅 張勁松
【機構】上海市農業科學院食用菌研究所農業部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心國家食用菌加工技術研發分中心 上海市農業遺傳育種重點開放實驗室
摘要：對"滬農靈芝1號"(簡稱滬靈芝)(Ganoderma lucidum SH)等10個代表性的擔子菌物種進行全基因組次級代謝物(secondary metabolite,SM)簇分析,結果顯示滬靈芝聚酮合酶(polyketide synthases,PKS)的骨架基因以及SM簇的數量分別為5和3,高于其它物種,并且都位于支架的末端。通過生物信息學分析發現,PKS7和9的SM簇只在滬靈芝中分布;只有PKS7的SM簇(PKS7簇)的骨架基因具有完整的I型PKS功能模塊;只有PKS7簇的骨架基因具有單拷貝直系同源性;PKS7簇的功能注釋基因在不飽和脂肪酸生物合成通路中富集。這些結果表明PKS7簇為滬靈芝特異性的SM簇,可能代表了滬靈芝抗逆性強的分子特征。
基金：國家自然科學基金(31401933)； 上海市農委[滬農科攻字(2014)第7-1-7號]項目； 上海市農科發[2013(10)]項目資助；
關鍵詞：靈芝; 比較基因組分析; 次級代謝; PKS; 通路富集分析;