【作者】張磊 仝宗軍 嚴俊杰 黃蓉梅 劉媛媛 李冰玉 汪健芳 謝寶貴
【機構】福建農林大學生命科學學院菌物研究中心
摘要：基于金針菇(Flammulina velutipes)基因組和轉錄組數據,運用本地BLAST方法,找到一個小G蛋白Ran的編碼基因,命名為FvRan1。運用生物信息學方法進行分析,結果顯示:該基因全長為1337bp,編碼區長度為1079bp,包含7個外顯子和6個內含子,其中4個內含子(I1、I2、I3、I6)在mRNA加工過程中存在可變剪切現象。通過氨基酸序列同源比對和系統發育分析發現,FvRan1具有5個G-Box保守結構域和2個效應器開關,與擔子菌中Moniliophthora roreri以及Trametes versicolor的親緣關系最近。采用RT-qPCR研究FvRan1在不同生長時期及部位、伸長期菌柄的不同部位以及豎直、微重力(旋轉)、水平3個不同處理條件下的表達量,結果表明,FvRan1在成熟期菌柄中的表達量最高;在金針菇伸長區段的表達量顯著高于生長點和非伸長區段;在模擬微重力條件下,FvRan1呈顯著上調表達。FvRan1基因在金針菇菌柄伸長與重力應答過程中可能具有正調控作用。
基金：國家“973”項目(2014CB138302)；
關鍵詞：金針菇; Ran蛋白; 菌柄伸長; 重力刺激; 熒光定量PCR;