酵母菌喜歡培養料含氮量高、溫度高和偏酸性的環境，28 ℃以上繁殖生長極快。酵母菌的菌落的菌落特征是：光滑、潤濕、不透明，灰白、乳白或紅色，有酸味或酵母味，也很像稠鼻涕，菇農也稱之為“熱鼻涕”。
防治方法：在配料時搭配好碳源和氮源的比例，把pH 值調節稍高一點，達到8.5 ～9.5 ，因在培養過程中，生石灰很快變化成熟石灰，培養料在發酵期間也產生酸（特別是陳舊的培養料）；搞好培養室的清潔衛生，定時噴灑消毒藥品；加強通風換氣，經常觀察料溫，發現料溫過高要及時疏散菌袋散熱。若在冬天氣溫低的季節發現細菌污染，應把污染的菌筒搬到室外溫度低的地方（不能在0 ℃以下），因平菇菌絲有耐低溫而不耐高溫的特點，在低溫時細菌不易繁殖甚至死亡，而平菇菌絲慢慢生長，逐步戰據優勢，最后長滿菌袋出菇。也可用0.01% 苯來特注射污染處紡織。
