一、發生爛棒的原因分析
1.菌種選擇不當：錯誤地將在段木上栽培表現良好的菌株，不經過適應性和抗霉性試驗，盲目地應用于袋料黑木耳上，由于菌種不適應環境，發菌緩慢，引起雜菌感染，發生爛棒。
2.季節安排不當：一是春栽黑木耳接種期安排過遲或秋栽黑木耳接種期安排過早，造成養菌期間超溫，菌絲體內細胞質營養液流出，受到環境因素的影響，表現吐黃水現象。出現吐黃水的栽培袋，袋內其他菌絲被粘液包圍，生理活動受到限制，菌絲逐漸死亡，高溫高濕條件下各種雜菌趁機感染。二是秋栽黑木耳栽培季節安排過遲或春栽黑木耳接種期安排過早，發菌期間氣溫低于20℃，菌絲生理活性低，發菌緩慢，不能迅速地占領培養料，引起雜菌感染，導致菌棒腐爛。
3.養菌期間管理不當：發菌前期黑木耳菌棒所處的室溫較低，引起個別接種穴菌絲死亡，感染雜菌；發菌后期，氣溫漸漸升高，加上菌絲體呼吸作用放出熱量，當氣溫超過25℃時，沒有及時采取通風降溫措施，發生燒堆悶菌現象；另外發菌期間通風不良，不能有效地排出培養室內的CO和其他有毒氣體，使菌絲活動受阻，活力下降，引起雜菌感染。
4.耳棚未清理干凈或靠近污染源：生產中使用舊耳棚，在采耳過程中培養基、子實體及已受感染的塑料袋及其它污染物未清理干凈，耳棚未經過消毒，成了雜菌繁殖的培養基；有的耳棚直接靠近污染源或使用了被污染的水，直接產生雜菌，引起菌棒腐爛，造成經濟損失。
5.出耳期間水分管理不當：在木耳原基形成期，澆水過早，木耳原基未封住劃口，水流進或滲入劃口內，造成感染。木耳原基分化期，剛形成的子實體原基處于芽孢狀態，芽孢因吸水過多而發生細胞破裂，劃口處菌絲停止生長而退菌，形成的子實體原基失去菌絲營養供應而停止生長，造成霉菌感染或流耳。
6.耳棚內通風不良：耳棚選址不當，或棚頂、棚周覆蓋物太厚或通風不及時等原因，使耳棚內缺氧，CO和其它有毒氣體積聚，木耳菌絲生活力下降，子實體生長緩慢或停止生長，為雜菌繁殖生長提供條件，發生爛耳或流耳現象。
7.采耳過晚：黑木耳子實體營養豐富且又是膠質狀，采收不及時，子實體老化變薄，失去彈性，不但質量差，而且極易產生霉菌，造成流耳、爛耳現象。
二、應采取的對策
1.選好菌種：選擇菌齡在35天～45天，發菌良好、菌絲潔白，生長粗壯，抗雜性強、產量高、耳片大、肥厚、顏色深的黑木耳菌種。經過試驗，在生產中表現較好的有Au01、Au02、Au03、Au04等菌株。
2.科學安排栽培季節：黑木耳栽培分春栽和秋栽，秋栽接種期一般安排在8月～9月，當氣溫低于30℃時接種，春栽接種期一般安排在旬平均氣溫上升到20℃往前推60天～65天接種，不同地區應根據海拔高度不同適當提前或推后。
3.適溫養菌：黑木耳菌絲在發菌階段需在完全黑暗的條件下進行，發菌溫度在5℃～36℃之間，最適溫度為24℃～28℃，秋栽黑木耳在發菌的前期和春栽黑木耳在發菌的后期，當氣溫起過25℃時，每項天至少應給培養室通風2次～3次，且晴天通風須在早晚進行。另外春栽黑木耳在發菌前期，當氣溫低于20℃時，應給培養室加溫，使培養室溫度達到22℃～24℃。
4.管理科學：黑木耳在不同的生長階段對溫、濕度和通風的要求是不同的，在木耳原基形成期，保持相對濕度在80%左右，并適度通風；在原基分化形成期，珊瑚狀耳芽相當幼嫩，保持相對濕度80%～90%，此時如果濕度過大，應立即停止噴水3—5天，耳基稍干后再澆水，在子實體生長階段，為促進耳片快速生長，要堅持三干七濕的原則，加大通風，干濕分明，相對濕度保持在90%～95%之間。
5.適時采收：當子實體耳片充分展開，邊緣變薄，耳根收縮、八分成熟時采收。采收時一手握住菌棒，一手捏住耳根，輕輕旋轉，不能在菌棒上留有耳蒂，以免引起雜菌感染。
