金針菇經鋁塑復合袋包裝之后，不僅能有效延長保質期，方便運輸，攜帶，而且能改善商品外觀，提高商品附加值。包裝前，要剪去新鮮金針菇柄基部褐色段，并剔除畸形、帶病蟲斑點和大小不均的菇體，再按下述標準分級。一級：柄長大于12厘米，蓋徑1.5厘米，色略黃白；二級：柄長10―12厘米，蓋徑1.0―1.5厘米，色較深黃；等外品：10厘米以下細柄、小菇，或基根粗老、色深。選分后便可進行包裝操作，同時注意避免與鐵、銅質的器皿接觸，以防影響色澤。
1.漂洗：新鮮菇放入0.05%焦亞硫酸鈉溶液或0.5%食鹽溶液中清洗兩次，再用流動水沖洗1―2遍，盡量減輕污垢殘留。
2.軟化、護色：凈水中添加0.5%的檸檬酸，預熱至90℃左右后，放進金針菇浸泡3―5分鐘。此舉既可使金針菇組織軟化，便于包裝，又能破壞其酶活性，穩定菇色。撈起后取清水洗去菇體表面的分泌物，瀝干。
3.裝袋，灌湯汁：將一束50―100克燙漂過的金針菇裝入復合袋內，然后灌入占總量的5%―10%的湯汁。湯汁的配法：水10公斤、精鹽250克煮沸，接著拌入檸檬酸50克、味精10克、山梨酸鈉防腐劑5克，用紗布過濾。
4.密封、殺菌：復合袋灌入湯汁后，立即用熱封機封口。袋口密封寬度一般不得低于0.6厘米。殺菌時，蒸汽溫度控制在110―115℃，時間10―15分鐘。殺菌完畢，迅速放冷水下淋降溫至40―50℃，揩干，擱置5―7天后檢驗，剔除膨脹袋，合格袋貼商標入庫。
