DNA分子標記技術在食用菌研究中的應用及進展
Application and Prospect of DNA Molecular Markers in Edible Mushroom Researches
吳學謙 李海波 魏海龍 吳慶其 彭華正 金群英
摘 要：根據近年來國內外的文獻報道,對DNA分子標記技術在食用菌遺傳育種、菌種和菌株鑒定、遺傳多樣性分析、基因定位和克隆等研究中的應用及進展進行了綜述和分析.認為隨著分子生物學技術的進一步發展,將有更多、更有效的分子標記在食用菌研究中得以應用,同時隨著分子標記技術應用的深入,更高密度、更為實用有效的遺傳連鎖圖譜將被建立,大量重要的功能基因將被定位和克隆,這將為進一步培育高產、優質、抗病、耐貯等食用菌新品種奠定良好的基礎.
關鍵詞：食用菌;DNA分子標記;遺傳育種;遺傳多樣性;基因定位及克隆
分類號：S646 文獻標識碼：A
文章編號：1001-3776(2004)02-0075-06
作者簡介：吳學謙(1964-),男,浙江慶元人,研究員,從事食用菌育種與栽培研究.
作者單位：吳學謙（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
李海波（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
魏海龍（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
吳慶其（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
彭華正（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
金群英（浙江省林業科學研究院生物技術研究所,浙江,杭州,310023）
參考文獻：
［1］羅信昌.第15屆國際食用菌科學和栽培大會簡介[J].菌物系統,2000,19(4):583-584.
［2］Castle A J, Horgen P A, Anderson J B. Restriction fragment length Polymorphisms in the mushroom Agaricus brunnescens and Agaricus bitorquis[J]. Appl Environ Microbiol, 1987, 53 ( 4 ) : 816 - 822.
［3］Khush H S, Becker E, Wach M. DNA Amplification polymorphisms of the cultivated mushroom Agaricus bisporus[J]. Appl Environ. Microbiol,1992 (58) : 2971-2977.
［4］詹才新,凌霞芬,楊家林.雙孢蘑菇性親和性相關分子標記的初步篩選[J].食用菌學報,2002,9(4):1-8.
［5］代江紅,林芳燦.香菇自然群體中個體間的空間分布及其遺傳聯系[J].菌物系統,2001,20(1):100-106.
［6］林范學,林芳燦.香菇親本菌株及其雜交后代的RAPD分析[J].菌物系統,1999,18(3):279-283.
［7］葉明,葉生梅,馬桂榮,等.香菇不同供體雙單雜交育種研究[J].中國食用菌,2000,21(5):3-4.
［8］詹才新,朱蘭寶,楊新美.RAPD技術在金針菇雜交育種中的應用[J].食用菌學報,1995,2(1):7-11.
［9］Zeng R, Liu Z T. Inactivated protoplast electrofusion of edible mushrooms and characterization of intergeneric fusion products [R]. In: Abstracts of 3rd International Conference of Mushroom Biology and Mushroom Products. 1999, 51
［10］肖在勤,譚偉,彭衛紅,等.金針菇與鳳尾菇科間原生質體融合研究[J].食用菌學報,1998,5(1):6-12.
［11］羅信昌,李英波,施慶利.分子生物學技術在菇類研究中的應用[J].食用菌學報,1995,2(4):1-10.
［12］吳康云,邊銀丙.黑木耳種內雜交子的鑒定技術[J].菌物系統,2002,21(2):210-214.
［13］李榮春,張麗梅.隨機擴增多態DNA(RAPD)在野蘑菇雜交育種中的應用[J].微生物學通報,2001,28(5):52-55.
［14］葉明,葉生梅,潘迎捷,等.不同來源香菇雙-單雜交后代的遺傳研究[J].南京農業大學學報,2000,25(1):53-56.
［15］譚琦,潘迎捷,陳明杰,等.香菇申香10號菌種的選育與推廣[J].食用菌學報,2000,7(3):6-10.
［16］譚琦,楊建明,陳明杰,等.用RAPD技術對香菇非對稱雜交后代遺傳性狀的分析[J].食用菌學報,2001,8(2):10-14.
［17］羅信昌.第15屆國際食用菌科學和栽培大會簡介[J].菌物系統,2000,19(4):583-584.
［18］邊銀丙.食用菌菌種質量問題與菌種管理對策的商榷[J].中國食用菌,1999,18(4):12-14.
［19］Hibbett, D S. Phylogenetic relationships of the basidiomycete genus Lentinus: Evidence from ribosomal RNA and morphology[D]. Duke University, Durham, North Carolina, 1991, 270.
［20］Hibbett D S, R Vilgalys. Evolutionary relationships of Lentinus to the Polyporaceae: Evidence from restriction analusis of enzumatically amplified ribosomal DNA [J]. Mycologia, 1993 ( 83 ) : 425 - 439.
［21］Kulkarni R K. DNA polymorphisms in Lentinula edodes, the shiitake mushroom [J]. Appl Environ Microbiol. 1991 ( 57 ) : 1 735 - 1 739.
［22］Assigbetse K B, Femandez D, Dubcis M P, et al., Differentiation of Fusarium Oxyspomm f. sp. Vasifectum races on cotton by random amplified polymorphic DNA (RAPD)analysis[J]. Phytopathology, 1994 ( 84 ) : 622 - 626.
［23］Molnar O, Messner R, Prillinger H, et al. Genotypic identification of saccharomyces species using random amplified polified polymorphic DNA analysis [J]. System Appl Microbiol, 1995 ( 18 ) : 136 - 145.
［24］Ramirez L, Muez V, Alfonso M, et al. Use of molecular markers to differentiate between commercial strains of the button mushoom Agaricus bisporus[J]. FEMS Microbiol Lett, 2001 . 198 ( 1 ) : 45 - 48.
［25］曾東方,羅信昌.應用RAPD分析快速鑒定外生菌根蘑菇分離物的真偽[J].林業科學,2001,37(6):59-65.
［26］李英波,羅信昌,李濱,等,香菇菌株限制性片段長度多態性[J].中國食用菌.1995,14(2):10-16.
［27］張引芳,潘迎捷,陳春濤,等.中國香菇栽培品種的遺傳相關性研究[J].農業生物技術學報.1996.4(2):141-146.
［28］王鐳,譚琦,陳明杰,等.從DNA水平上分析香菇不同菌株的遺傳差異[J].食用菌學報,1997,4(4):2 J-24
［29］詹才新,朱蘭寶,楊新美.利用RAPD技術評估金針菇種質資源[J].食用菌學報,1997,4(1):1-7.
［30］詹才新,張引芳,凌霞芬,等.中國主栽雙孢蘑菇菌株的DNA多態性[J].食用菌學報,1998,5(2):1-7.
［31］施慶利,羅信昌.RAPD技術在木耳雜交種及原生質體融合子鑒定分析中的應用[J].中國食用菌.1994,12(6):3-4.
［32］羅信昌,曾東方.外生菌根蘑菇分離菌株的DNA鑒定方法[J].微生物學雜志,2001,21(2):26-29.
［33］閻培生,羅信昌,周啟.利用RAPD技術對木耳屬菌株進行分類鑒定的研究[J].菌物系統,2000,19(1):29-33.
［34］沈天峰,王朝江,羅信昌,等.木耳屬四個野生菌株的RAPD圖譜分析[J].食用菌學報,2001,8(4):1-4
［35］黃志龍,謝寶貴,謝福泉,等.15個代料栽培香菇菌株的分子鑒別[J].食用菌學報,2002,9(3):5-8.
［36］陳明杰,趙紹惠,張樹庭.用分子生物學技術對草菇進行菌株鑒別[J].真菌學報,1996,15(2):129-134.
［37］陳明杰,凌霞芬,王南,等.草菇組織分離物的遺傳變異研究(Ⅱ)[J].食用菌學報,2000,7(2):1-4.
［38］Molina FI, Shen P, Jong S H, et al. Molecular evidence supports the separation of Lentinula edodes from Lentinus and related genera[J].Can J Bot, 1992 ( 70 ) : 2 446 - 2 452.
［39］Nicholson M S, Bunyard B A, Royse D J. Phylogeny of the genus Lentinula based on ribosomal DNA restriction fragment length polymorphism analysis [J]. Mycologia, 1997, 89 ( 3 ) : 400 - 407.
［40］曾偉.宋思揚,王澤生,等.雙孢蘑菇及大肥菇的種內及種間多態性RAPD分析[J].菌物系統,1999(18):55-60.
［41］李榮春.雙孢蘑菇遺傳多樣性分析[J].云南植物研究,2001,23(4):444-450.
［42］Sagawa I, Tanaka M, Nagata Y. Discrimination of mushrooms in genus Pleurotus by DNA restriction fragment length polymorphism [J].J Gen Appl Microbiol, 1992 ( 38 ) : 597 - 603.
［43］馬富英,羅信昌.28SrDNA PCR-RFLP分析在側耳屬系統發育研究中的應用[J].華中農業大學學報,2002,21(3):201-205.
［44］鮑大鵬,王南,陳明杰,等.采用ARDRA和RAPD對柳松菇菌株遺傳多樣性的分析[J].上海農業學報,2001,17(1):18-22.
［45］Bunyard B A, Nicholson M S, Royse D J.A. Systematic assessment of Morchella using RFLP analysis of the 28S ribosomal RNA gene [J].Mycologia, 1994, 86 ( 6 ) : 762 - 772.
［46］曾東方,羅信昌,陳升明.珍稀共生食用真菌松茸DNA指紋研究[J].園藝學報,2000,27(3):223-225.
［47］Moncalvo J M, Wang H H, Hseu R S. Phylogenetic relationship in Ganoderma inferred from the internal transcribed spacers and 25S ribosomal DNA sequences[J]. Mycologia, 1987, 79 ( 2 ) : 223 - 238.
［48］Anderson J B, Petsche D M, Smith M L, et al. Restriction fragment length polymorphisms in biological species of Armillaria mellea [J].Mycologia, 1987 ( 79 ) : 69 - 76.
［49］秦國夫,賀偉,沈瑞祥.中國蜜環菌生物種的RAPD分析.真菌學報,1996,15(1):26-33.
［50］Lanfranco L, Myss P, Marzachi G, et al. DNA Probes for identification of the ectomycorrhizal fungus Tuber magnatum Pico [J]. FEMS Microbiol Lett, 1993 ( 114 ) : 245 - 252.
［51］Gandeboeuf D, Dupre C, Nicolas P, et al. Grouping and identification of Tuber Species using RAPD markers [J]. Can J Bot, 1997 ( 75 ): 36 - 45.
［52］閻培生,羅信昌,周啟.木耳屬真菌rDNA特異性擴增片段的RFLP研究[J].菌物系統,1999,18(2):206-213.
［53］陳作紅,張志光,張天曉.鵝膏菌屬真菌RAPD分析及親緣關系的研究[J].菌物系統,2000,19(1):51-55.
［54］Kerrigan R W, Royer J C, Baller L M, et al., Meiotic behavior and linkage relationships in the secondarily homothallic fungus Agaricus bisporus[J]. Genetics, 1993 ( 133 ) : 225 - 236.
［55］Larraya L M, Perez G, Ritter E, et al., Genetic linkage map of the edible basidiomycete Pleurotus ostreatus [J]. Appl Environ Microbiol, 2000,66(12) : 5290-5300.
［56］Xu J, Kerrigan R W, Horgen P A. et al., Localization of the mating type gene in Agaricus bisporus[J]. Appl Environ Microbiol, 1993 ( 59 ) :3 044 - 3 049.
［57］Lofius M G, Lodder S C, Legg E J. Molecular mushroom breading. In: Elliott TJ (ed.), Science and Cultivation of Edible Fungi. The Netherlands: Balkema, Rotterdam. 1995, 3 - 9.
［58］Sonnerberg A S, de Groot P W, Schaap P J, et al. Isolation of expressed sequence tags of Agaricus bisporus and their assignment to chromosomes [J]. Appl Environ Microbiol, 1996, 62 ( 12 ) : 4 542 - 4 547.
［59］宋思揚,曾偉,陳融,等.一個與雙孢蘑菇子實體品質相關的DNA片段的克隆[J].食用菌學報,2000,7(3):11-15.
［60］陳蘭芬,宋思揚,鄭忠輝,等.RT-RAPD技術分析高溫誘導雙孢蘑菇相關基因片段[J].廈門大學學報(自然科學版),2002,41(1):103-107.
［61］潘迎捷.國際食用菌研究進展[J].吉林農業大學學報:1998,20(增刊):64-66.
［62］陳明杰,譚琦,嚴培蘭,等.草菇低溫誘導基因的分離[J].菌物系統,1998,17(4):327-330.
［63］Muraguchi H, Kamada T. The ichl gene of the mushroom Coprinus cinereus is essential for pileus formation in fruiting [J]. Development, 1998,125 (16) : 3133-3141.
浙江林業科技
JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY SCIENCE AND TECHNOLOGY
2004 Vol.24 No.2 P.75-80
