目前大量栽培的食用菌如平菇、香菇、金針菇、猴頭菇、木耳、銀耳及雙孢蘑菇等，大致可分為菌絲體階段和子實體階段或兩個生長發育時期。每種菇在這兩個階段中所要求的條件有相同之處，又有差異。這時它們的生物學特性所決定的，若能創造它們所需要的良好條件，便可取得高產優質。
一、營養物質，主要是碳、氮及礦物元素。
1.碳素養分是構成菌絲體、子實體的主要成分，又是它們生長發育所需能量的來源。碳素物質約占菇體成分（干物質）的50%—65%。栽培中所用棉殼、木屑等培養基是碳素的主要來源。
2.氮素養分是蛋白質、核酸的主要原料。同樣是菌絲體和子實體的主要成分，也是食用菌香鮮美味的物質基礎，特別是豐富的氨基酸（18種之多），無氮是形成不了的。
碳、氮養分對食用菌正常發育不僅需有充足的數量，而且要求其比例合理，通稱碳氮比。各種菇的這種比例，菌絲體生長階段以20：1，子實體發育階段以30—40：1為宜。生產中因培養料種類不同，有時加麥麩、玉米粉、豆餅粉，加硝酸銨、尿素等，調節其碳氨比。不論什么菇千篇一律，甚至不照原配方用料，任意變動，缺這少那，這都難以取得高產優質。
3.礦質元素食用菌正常生長還需要鈣、鎂、磷、鉀、鐵、鋅等礦物元素和微量元素。這些物質雖需量不大，但都重要，一般在主要料中的含量便可滿足需要。有時也添加如硫酸鎂、草木炭（鉀）和雞糞（磷）等。
二、水分和濕度
水是菌絲體和子實體的主要成分之一，更重要的是生命活動的新陳代謝，沒有水便不可能進行。鮮菇體所含水分高達85%—90%。培養基中的水是食用菌生長發育所需水分的主要來源，但水太多反而不利。適宜含水量為65%—75%。以料吸足水用手握指縫出水而不下滴為度。以棉籽殼為例，料與加水的重比大致為1：1.2—1.5，加得過多，則妨礙菌絲生長。
濕度，多指空氣相對濕度，這不僅與食用菌生長發育有直接關系，而且還影響料內水分的散發，特別是在子實體發育期間，若濕度不足定會減產，若低于60%子實體不生長，低于45%原基停止分化，甚至于死已有原基。適宜的空氣濕度為85%—93%（子實體生長期）。栽培過程中以噴霧方式加水，提高空氣相對濕度是必需的措施。特別是后期，還往培養基中注水或浸泡培養基，均可相應增加產量。
三、濕度
各種菇都需在一定溫度條件下才能正常生長發育。菌絲體和子實體生長發育過程中對溫度的要求是不同的，有的還“喜歡”變溫條件，如平菇每天若能給予10℃的溫差刺激，則利于子實體的形成和發育。如上列栽培較多的幾種菇，菌線生長的適宜溫度大致在25℃（木耳30℃）左右，子實體發育的適溫一般在15℃左右，草菇喜溫，菌線以35℃發育較好，子實體在30—32℃下發育好。
溫度是影響食用菌生長發育的重要因素，生產中目前多利用自然季節栽培，主要是根據自然溫度條件安排生產（人工空調也主要是創造溫度條件）。隨著科技的進步現在正在改良食用菌品種，改變其溫度特性是主要目標之一，如平菇、香菇，已培養出在較低、中溫型、高溫型，甚至溫度限不嚴格的廣溫型。由此可以根據栽培時期的溫度條件選用相應的品種，擴展栽培時期。
四、氧氣和二氧化碳
各種食用菌若氧不足菌絲生長就不良，子實體也長不好。因為在生長發育過程中食用菌自己還放出二氧化碳，所以栽培場所要通風換氣。
五、光線
食用菌對光的要求不強，菌絲體可以在黑暗條件下生長。子實體分化、生長時需一定的散射光，忌強光直射。完全黑暗，子實體發育不良和慢。光照可以增加其色澤，無光色淡。光照還與溫度有關，北方用大棚栽食用菌需日光升溫，但要注意防止溫度過高，光太強，多用草簾等遮陰。
六、酸堿度
食用菌多喜微酸性環境，一般ph值不超過7（中性），約在5.5—6.5之間，但平菇較耐堿，ph值8時也可生長。而猴頭菇耐酸，ph5時也可以生長，栽培過程中要加糖等會變酸的物質，高溫滅菌過程也會使培養基變酸。還應注意當地水質，即其ph值。在配料時應注意創造適宜的酸堿度環境，有的加石灰或加硝酸銨等酸性肥料，一則增加鈣、氮素，二則可調節培養料的ph值。
為防止過酸或過堿，加一定量的石膏，可以起緩沖作用。
