內蒙古自治區食用菌協會是內蒙古自治區供銷合作社聯合社為貫徹落實《國務院辦公廳關于加強鮮活農產品流通體系建設的意見》（國辦發〔2011〕59號），加強對同屬于鮮活農產品的食用菌產業生產、流通、銷售等環節的服務，積極為我區食用菌行業爭取政策、資金、項目支持，提升我區食用菌產業的科技和標準化水平，打造名牌、培育龍頭，探索提升我區食用菌產業鏈條各個環節核心競爭力的途徑，助推全區食用菌產業快速健康發展，而決定成立的全區性行業組織。
內蒙古自治區食用菌協會的業務主管單位是內蒙古自治區供銷合作社聯合社，牽頭籌建單位是區社直屬企業內蒙古綠泰源農產品開發有限公司。
