隨著我國茯苓道地藥材優化縮減，野生資源改為人工栽培，茯苓資源栽培格局發生了變化。王文全教授介紹，市場流通的一級茯苓菌種主要流向相關科研機構、較有實力的茯苓企業、小規模的專業種植，二級、三級茯苓菌種則就地銷售給地方農戶。在生產上使用的茯苓菌種，報道菌種40余種，各地有自主菌種。湖南湘靖•28，全國各地均有采購，中國科學院微生物研究所的5•78，大別山地區仍然在使用。不同產區茯苓生產方式也在傳統生產工藝上得到不斷優化，如“大料變小料”，“長料變短料”，在傳統的“木引”“肉引”基礎上，優化為“嫁接法、誘引法、雙引法”。培養基物料種類也不斷革新，茯苓代料栽培技術為挽救林木流失、茯苓產業可持續發展，提供了創新性的技術支撐。技術科研進展上，李劍、王克勤、蘇瑋等，開展了棚室內以代料方法栽培茯苓的研究，代料以松木屑、松枝碎塊為主要原料，配以石膏、蔗糖等。祺研究以松根62.5%、松木屑9.5%、米糠14.5%、玉米芯11.5%、蔗糖1%，取得較好的試驗效果。在科研成功推動上，湖南補天藥業公司主持的“大宗道地藥材茯苓栽培與加工關鍵技術研究及產業化”榮獲2013年度湖南省人民政府科技進步一等獎。生產技術規范化程度逐步提高，生長發育周期由10~12個月縮至6~8個月。各產地加工模式也呈現多樣化，通過“發汗”，晾至表面干，反復數次，陰干后得到“茯苓個”；將鮮茯苓切制，陰干后得到“茯苓塊”和“茯苓片”。茯苓采收加工模式有“鮮茯苓采收-發汗-剝皮-切制-干燥”，“鮮茯苓采收-發汗-蒸制-剝皮-切制-干燥”，“鮮茯苓采收-蒸制-剝皮-切制-干燥”，“鮮茯苓采收-切制-干燥”，有的加工還用了蒸制工藝。
