將菌物開發成為營養食品及藥物并科學應用于臨床，將有助于大幅提升醫療品質，已逐漸成為醫療領域的一個共識。為此，越來越多的科研及醫療機構開拓課題并開展了大量的研究，每年發表的相關論文呈高幅度增長態勢。
莊毅教授帶領的團隊選擇藥用真菌槐栓菌，以黃芪為基質，雙向性發酵成槐芪菌質（清膏），較對照組免疫力增強、保肝作用明顯，抗乙肝肝炎病毒效果顯著。又采用一定菌種對毒性強的雷公藤進行雙向發酵，獲得的“靈雷菌質”中雷公藤甲素含量較原藥材降低5倍。又以灰樹花、羊肚菌、猴頭菌對馬錢子為基質發酵后，馬錢子類生物堿成分發生質與量明顯變化，具有減毒增效表現。還利用“中藥渣”轉化的菌質研制抗病、預防禽流感的獸藥。余伯陽對延胡索生物堿、貝母堿、青蒿素類等化合物，通過多種含不同轉化酶系的菌物進行轉化，取得活性優于底物的產物，具有較經典有機合成更迅速，有效合成大量化合物與眾多同系物，彌補化學合成的不足，并提出開拓一門新科學“生物組合化學”。章克昌等采用靈芝轉化蒽苡仁等10味中草藥，認為轉化底物總體成分含量増加，具有新功能成分，不良成分減少，是關鍵酶的作用。秦俊哲等采用靈芝對防風等六味中藥渣進行固體栽培，菌質多糖為對照組子實體2倍，氨基酸總量2.64倍。黃維等進行裂褶菌與酸棗仁、黃芪液體發酵，試驗結果表明，黃芪組、酸棗仁組發酵終點時菌絲量與多糖、皂甙含量均顯著較對照組提高。
按照莊毅教授的定義，菌物藥在中藥范疇應該分為藥用真菌和真菌藥物。藥用真菌指的是中 藥范疇內的具有藥用價值的菌物經過科學炮制后獲得的菌藥飲片，如靈芝飲片等。而真菌藥物則指的是經過固體發酵而產生的真菌藥物，如神曲等。菌物藥具有發展潛力巨大、臨床涉用面廣、生產工藝多的優點。
科研的性質決定了其課題要有一定的技術性，因此，很多實驗結果要轉化為實際應用成果，還有很多的制約因素。而現代生活方式的巨大改變，致使大量具有極大破壞性的慢性疾病成為了常見病，傳統藥物及醫療方式在這種現狀面前往往“巧婦唯為無米之炊”， 藥物研究往往落后于疾病發展 10年以上。
因此，發展菌物藥具有時代意義。為了彌補科研和疾病發展的不平衡狀態，解決這一重大社會矛盾，運用傳統中醫理論，靈活運用這一新的藥物物種，就有了廣闊的現實需求。
將藥用真菌根據中藥原理，進行藥性辨析，規范炮制標準，和其他中藥結合，取長補短，開 發膏、丸、散、丹、湯等傳統中藥劑型，快速應用于臨床，重傳承、快創新，不失為一條擴展菌物藥外延的捷徑。
陳增華教授帶領的團隊和北京中藥研究所設立的菌物藥研究中心已確定菌物藥飲片藥性品種達到380余種，并正對400多種菌物藥的藥性進行深入研究。對于藥食兩用菌物藥的健康應用也在膏方、片劑、顆粒、湯劑等方面確立了多項標準，取得了良好的市場反響。
因此，菌物藥的臨床應用或產品開發，不僅需要在固體發酵、分子篩選等高科技、高投入、 長周期的條件下不斷深入，更應有“回頭看”的思維，在中醫理論的指導下，以“更適宜”的方 式，開發出適合現階段技術水平、市場需求的好的產品，補上理論和實踐脫節的短板，從而擴展菌物藥的應用外延。
