在福州舉辦的中國菌物學會2024年學術年會上，福建農林大學鄧優錦副教授做了題為草菇主栽品種NF-7全基因組分子標記的構建的報告分享。
食用菌作為一類具有食藥用功能的大型真菌，在推動循環農業和提高農民收入方面發揮了重要作用，也是脫貧攻堅的重要產業。然而，近年來隨著品種選育和引種栽培的快速推進，食用菌品種名稱的混亂問題日益凸顯，“同物異名、異物同名”的現象普遍存在，給食用菌生產帶來了不必要的困擾，也對種質創新造成了嚴重的阻礙。
草菇是發源于中國最著名的食用菌之一。因其在自然狀態下草菇生長在稻草堆中，俗稱“稈菇”(稻草菇)，也被稱為“中國蘑菇”。作為高溫食用菌和草生食用菌的代表，草菇的栽培周期極短，僅需14天，而備受青睞。因此鄧優錦副教授帶領團隊對草菇主栽品種NF-7進行了深入的全基因組分子標記研究。他們首先進行了草菇NF-7的異核基因組組裝，成功獲得了核A、核B的完整基因組序列以及線粒體基因組序列，并揭示了三者間的比例關系，從而全面掌握了草菇NF-7的遺傳信息。
在基因組組裝質量驗證方面，鄧優錦副教授采用了多種方法進行驗證，包括正向驗證、反向驗證、異核分型驗證以及染色體構架驗證等，確保了基因組組裝的準確性和完整性。他們還利用Hi-C交聯信號揭示了每條染色體構架的準確性，進一步提高了基因組組裝的可靠性。
基于全基因組信息，鄧優錦副教授開發了一套分子標記鑒定流程。該流程通過將待測菌株的基因組序列分割成100-bp片段集，并與參考基因組進行比對，從而計算出SNP數量，進而實現菌株的快速準確鑒定。該鑒定流程具有檢測準確性高、操作簡便等優點，可廣泛應用于食用菌產業的品種鑒定和種質創新中。
此外，鄧優錦副教授還利用該分子標記鑒定流程對菇廠采集的菌株進行了鑒定，成功區分了不同來源的菌株，為食用菌產業的種質資源管理和品種選育提供了有力支持。
據悉，由中國菌物學會主辦的“2024年中國菌物學前沿論壇，并在同期召開中國菌物學會第八屆理事會會議及《菌物學報》《菌物研究》編委會”將于12月27日至31日在海南?？谂e行。屆時，鄧優錦副教授將再次與大家相聚，并作題為“銀耳異核基因組非對稱現象及其附屬染色體多樣性分析”的報告分享，歡迎廣大從業者參會交流！
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