【作者】劉朋虎 謝寶貴 鄧優錦 江玉姬
【機構】福建農林大學菌物研究中心國家菌草工程技術研究中心
【摘要】從福建主栽品種屏優一號PY分離到2個不能正常出菇的單孢菌株PYd21、PYd15,二者配對雜交得到可正常出菇異核菌株H15-21。用solexa測序技術對PYd21基因組從頭測序(de novo sequencing),對PYd15、PYd21、H15-21的菌絲體分別進行數字基因表達譜測序,對8個樣品(PYd15、PYd21、H15-21的菌絲體,H15-21出菇后的原基、鈕扣期菌柄、蛋形期菌柄、伸長期菌柄和成熟期菌柄)mRNA等量混合物進行轉錄組測序?？寺y序了PYd21與PYd15中磷酸果糖激酶(PFK)基因,比對結果表明二者序列一致。利用轉錄組數據對PFK基因結構進行分析,結果表明:該基因全長3,494bp,有12個外顯子、11個內含子;開放閱讀框(ORF)全長2,457bp,編碼818個氨基酸,5′端非翻譯區(5′UTR)長度281bp,3′端非翻譯區(3′UTR)全長103bp;RNA在加工過程中存在1種可變剪切類型、6個可變剪切位點。數字基因表達譜分析結果表明,PFK基因在PYd21、PYd15及H15-21中的標準表達量分別為71.08、120.61、251.85(transcriptper million cleantags,TPM),表達量依次升高,與菌絲生長速度顯著正相關。并且異核菌株H15-21表達量高于2個單孢菌株之和,基因表達存在協同增效作用。采用實時熒光定量PCR技術對基因表達量進行驗證,表達譜數據切實可靠。
【基金】國家現代農業產業技術體系建設專項資金(No.CARS24)；
【關鍵詞】草菇; 基因結構; 可變剪切; 協同增效; 異核體;