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          草菇基因組中11個漆酶同源基因的生物信息學分析及銅離子對其表達的影響


          【發布日期】:2019-01-21  【來源】:菌物學報
          【作者】吳林 朱剛 陳明杰 汪虹 鮑大鵬
          【機構】國家食用菌工程技術研究中心 農業部南方食用菌資源利用重點實驗室 上海市農業遺傳育種重點開放實驗室 上海市農業科學院食用菌研究所上海海洋大學食品科學與工程學院
          【摘要】通過分析草菇基因組中11個漆酶同源基因所編碼的蛋白的性質、轉錄調控元件和測定銅離子存在條件下的草菇漆酶活性及11個漆酶基因的轉錄水平,揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差異以及基因功能與進化機制。分析表明,這11個漆酶同源基因編碼的蛋白具有508–562aa個氨基酸,分子量和理論等電點分別為56.25–60.75kDa和4.51–6.18(未經翻譯后修飾),且都具有真菌漆酶銅離子結合區域的特征序列、4個能夠結合催化底物的環形結構以及信號肽序列,都屬于分泌性的胞外蛋白,但其底物結合位點數目、loop序列的一致性、跨膜區域數目和位置以及信號肽位置等存在較大差異。草菇11個漆酶起始密碼子上游2 000bp的序列中含有真核生物的基本轉錄調控元件(TATA‐box,CAAT‐box及GC‐box)和多個潛在的調控元件(MRE、XRE、STRE、HSE、ARE、TRE、NIT元件等),但每個基因所含調控元件數目及種類各有不同。在液體培養條件下,銅離子能夠誘導除vv‐lac2、vv‐lac3和vv‐lac7之外的其余8個草菇漆酶基因的表達,且適宜濃度的銅離子有助于草菇漆酶活性的增加。 
          【基金】上海市科技興農重點攻關項目[滬農科攻字(2011)第1‐2號]; 上海市農業科學院科技發展基金[農科發2013(02)];
          【關鍵詞】草菇; 漆酶基因; 銅離子; 表達;
           
           
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