【作者】王孟蘭 趙妍 陳明 杰汪虹
【機構】國家食用菌工程技術研究中心,農業部南方食用菌資源利用重點實驗室,上海市農業遺傳育種重點開放實驗室,上海市農業科學院食用菌研究所南京農業大學生命科學學院
【摘要】木聚糖酶是半纖維素酶系的重要組成部分,能夠分解水稻、小麥等農作物秸稈中的半纖維素。研究探討木聚糖酶相關基因及其功能,為進一步探討木聚糖酶與草菇生物轉化率之間的關系提供理論依據。首先通過生物信息學手段構建了草菇2個木聚糖酶基因xyn1和xynII編碼氨基酸序列的系統進化樹,然后從生物轉化率不同的草菇菌株分別提取各自的RNA,反轉錄為cDNA后,采用實時熒光定量PCR技術分析了xyn1和xynII基因的轉錄表達情況;最后應用DNS法對這些菌株中的木聚糖酶活性進行了測定。研究結果表明,xyn1編碼的氨基酸序列與草腐菌相似性較高,而xynII編碼的氨基酸序列與木腐菌遺傳差異較小。在木聚糖酶活性測定和實時熒光定量PCR結果中,不同菌株的木聚糖酶活性趨勢與xynII的轉錄表達趨勢相似,均呈現依次遞減。草菇的木聚糖酶活性與其生物轉化率之間存在正相關性,推測草菇不同菌株木聚糖酶活性差異可能表現在轉錄水平上的差異。
【基金】上海市科技興農重點攻關項目(2011第1-2號)； 上海市市級農口系統青年人才成長計劃[滬農青字(2014)第1-17號]；
【關鍵詞】草菇; 木聚糖酶; 實時熒光定量PCR; 系統進化樹;