【作者】楊頊 戴欣 劉力 王雪薇
【機構】中國科學院微生物研究所真菌學國家重點實驗室中國科學院大學生命科學學院中國科學院微生物研究所微生物資源前期開發國家重點實驗室中國科學院微生物研究所網絡信息中心
【摘要】分別利用真菌通用引物和厭氧真菌特異引物構建了西藏地區3種反芻動物和1種單胃動物共8份新鮮糞樣的ITS克隆文庫,以通過系統發育分析解析其中好氧真菌與厭氧真菌的多樣性。通用引物ITS文庫測得324條真菌序列,分別屬于子囊菌門Ascomycota 3個目、擔子菌門Basidiomycota 2個目、接合菌門Zygomycota的1個目和嚴格厭氧的新麗鞭毛菌門Neocallimastigomycota,共24個OTUs。其中,子囊菌門相對豐度最高,占80.6%;新麗鞭毛菌門相對豐度最低,僅占0.6%。大部分OTUs與已知真菌屬、種關系較遠。厭氧真菌特異引物文庫測得661條序列,全部屬于新麗鞭毛菌門,包括所有已知的厭氧霉屬Anaeromyces、盲腸菌屬Caecomyces、腸霉屬Cyllamyces、新麗鞭毛屬Neocallimastix、奧式霉屬Orpinomyces、胃梨囊霉屬Piromyces 6個屬和3個未培養的屬級類群(NG9、NG10、NG11),共29個OTUs。其中3個已知的單中心屬存在于所有反芻動物樣品中,并以Piromyces相對豐度最高(37.4%)。單胃動物馬糞樣中全部為NG9類群。NG9是本研究新發現的屬級類群,研究中同時揭示有多個未培養種和潛在的新種。研究結果證明青藏高原反芻動物糞棲真菌多樣性較高,并存在豐富的未培養種和潛在的新屬及新種。
【基金】國家重點基礎研究發展計劃(No.2011CB100800)； 北京市自然科學基金項目(No.5092016)；
【關鍵詞】真菌; 新麗鞭毛菌門; 反芻動物; 單胃動物; 青藏高原;