1、黃曲霉毒素這是由某些黃曲霉菌株產生的肝毒性代謝物，以黃曲霉毒素B。為最常見，毒性也最大。
2、小柄曲霉毒素這也是一種致肝癌的毒素，只是毒性較低。
3、棕曲霉毒素 這是棕曲霉的毒性代謝物，有A、B、c三種同系物，以A的毒性最大。動物試驗，能致肝、腎損害和腸炎。曲霉類在食用菌栽培中是常見的競爭性雜菌，特別在以麩皮、豆粉、玉米粉等為配合成分的基質上更為常見。因此，選用培養基材料時，應選用新鮮無霉菌的材料。
4、青霉素這是由青霉屬的某些種類的霉菌產生的毒素。該毒素可致癌。
5、鐮刀菌毒素鐮刀菌主要分布在土壤中，能污染與土壤接觸的有機物，食用菌產品攤曬在地面也可受到鐮刀菌的污染。其毒素可導致人體白血球減少癥、皮膚炎癥、皮下出血、黃疸、肝損害等。
6、霉變甘薯毒素霉變甘薯毒素是甘薯被甘薯黑斑病菌和茄病鐮刀菌寄生后生理反應產生的次生產物，并非霉菌的代謝產物。主要毒素成分可導致人和畜肺氣腫、肝損害。食用菌產品可通過受污染的糧食、土壤等媒介而被污染。
