畸形菇 通風不順暢、菇室二氧化碳含量超過0.3％時，易出現畸形菇。出菇部位過深，在粗土縫間長出的菇也往往呈畸形。應重點注意菇房的通風換氣。
地蕾菇 培養料入菇房時濕度過大，粗土調水時菇房通風太久，覆蓋細土過遲，溫度較低等，容易產生地蕾菇。應掌握噴水適量、通風適時，使菌絲吊在黏土之上、細土之下。
紅根菇 栽培料偏酸，出菇前高溫階段田水過多，覆土層含水量過大，追施葡萄糖超量，菇房通風不良等都易導致紅根菇。應調整好培養料的酸堿度，覆土含水量保持在22％～25％，避免高溫時灑水，追肥濃度要適當。
水銹斑菇 菇房內及培養料表面噴水后沒有及時通風換氣，菇房濕度過大，蘑菇表面出現小水滴，時間一長，會形成鐵銹色的斑點。所以，每次噴水后應打開門窗30～60分鐘通風換氣。
空根白心菇 噴水太少，覆土層較干燥，子實體得不到充足的水分，菇柄產生白色髓部，甚至空心。預防措施主要是適時適量噴水，出菇期菇房空氣相對濕度保持在85％以上。
硬開傘菇 晝夜溫差達10℃，或遇強冷空氣襲擊，均會引起蘑菇硬開傘。當氣溫驟變時，菇房外應加蓋草簾，以保持菇房氣溫穩定、濕度適宜。
薄皮早開傘菇 出菇密度太大，溫度偏高，或濕度偏低，子實體生長快而柄細蓋薄，會提早開傘。注意保持菇房適宜的溫濕度，能有效預防薄皮早開傘菇的出現。
