雙孢蘑菇在出菇階段，因管理不善或受外界不良環境的影響，菇床上經常發生部分小菇蕾萎縮、變黃，最后死亡的現象，嚴重時床面的小菇成批死亡。
造成死菇的主要原因有：
1、培養料養分不足，出菇部位高，在土表層形成過密的子實體；采菇時操作不慎，損傷周圍小菇，影響小菇的正常生長發育而導致死菇。
2、由于氣溫突然升高，使菇房連續幾天高溫(21—25℃)，菇床水分蒸發和菇體新陳代謝加快，水分及營養供應不上，導致小菇因缺乏營養和水分而枯萎死亡。
3、菇房長期通風不良，二氧化碳濃度過高，氧氣不足導致部分幼菇死亡。特別是高溫時死菇尤為嚴重。
4、蘑菇對水分極為敏感。覆土層沒有及時補足水分，或出菇水和保質水噴施過量，或水分滲漏培養料，使料層上部積水導致菌絲死亡，造成小菇養分供應不上而枯萎。
5、蘑菇菌絲生長適宜pH值是6—8，在出菇期間，覆土層和施用水的酸堿度在5以下，就會出現菇蕾死亡現象。
6、過量地施用農藥，產生藥害，也會發生大量死菇。如果施藥后小菇變紅變褐，又查不出病原菌的，大都是由藥害引起。
防治措施：
1、覆土層調水階段，為防止菌絲長出土面，要壓低出菇部位，以免出菇過密。
2、春菇后期注意菇房降溫，防止高溫襲擊。
3、加強通風換氣，是降低相對濕度、防止二氧化碳積聚、避免雜菌孳生的有效措施。
4、在水分管理上應看時期、看天氣、看菇質，靈活掌握。以“晴天多噴，陰雨少噴；菇多勤噴，菇少慎噴”和“出菇水要狠，保質水要穩，轉茬水要重，維持水要常” 為原則進行科學管水。避免噴施關門水。
5、采用農藥防治蟲害應嚴格掌握使用濃度，避免用藥過量，造成藥害。
