夏季栽培雙孢蘑菇因氣溫高、濕度大、雜菌基數高。此時應針對這些特點，分階段地采取有效措施進行防治，可取得事半功倍的防治效果。
一、栽培發菌階段防治
由于高濕度的影響，使得栽培發菌成功率大為降低，主要表現為發菌緩慢、菌絲無力、污染率高等。主要防治措施：
1. 菌種脫毒、調配基料
脫毒菌種可確保自身不攜帶病毒病菌，并有效提高抗性，這是生產的基礎。研究證明，每250公斤棉籽殼原料中，加入50克食用菌三維營養精素(拌料型)，即可獲得菌絲旺盛、抗性提高、長速加快、污染率和發病率大為降低等效果。
2. 嚴格培養、徹底消毒
培養棚內的徹底消毒殺菌，是發菌成功的重要保證條件之一。生產中對培養室(棚)內噴灑百病去無蹤或百病傻，密閉2天后即可啟用，在發菌期間，每5天左右噴灑一遍賽百09藥物或蘑菇殺病靈，是行之有效的預防措施。
3. 通氣排濕、細心管理
一方面，堅持晴朗天氣的晚間和早上通風，使之空氣新鮮；另一方面，培養室（棚）內放置生石灰塊，使之降濕。但應注意，在無空調降溫的條件下，應采取諸如強制通風等措施，細心管理，以確保發菌的成功。
二、出菇階段的防治
實踐證明，對食用菌生產中的病害，轉變傳統重“治”輕“防”觀念，堅持“以防為主，防治并重”的原則，即可收到事半功倍的防治效果。生產中可參考下列措施：
1. 菇棚內外進行消殺。在清理衛生的基礎上，棚外噴灑800倍多菌靈藥液，棚內使用百病去無蹤或賽百09進行地毯式噴灑，環境較差、老栽培棚可噴2次，曝曬2天后即可啟用。
2. 拌料時加入賽百09藥物，抑殺雜菌效果好，藥物殘留低，可有效降低發菌污染率。
3. 出菇階段定期使用藥物以保持良好環境。一般可使用賽百09藥物對菇棚進行噴灑，環境較差的可使用百病傻藥物，每5天噴1次，抑制或殺滅后來的病原菌等，以保持環境的相對潔凈。
4. 發現病害徹底殺滅。上述措施配套使用，仍難以保證100%不發病。因此，生產中應注意觀察，發現菌袋有病菌跡象時，即應對患處使用消霉王等藥物予以殺滅，也可采用賽百09浸洗菌袋；當子實體初發病害，即應根據病癥表現或病原菌品種予以用藥。
