食用菌工廠化生產是我國現代農業和生物農業的新亮點，在發達國家工廠化食用菌生產比例已高達90%。而相對于傳統生產模式，我國食用菌工廠化生產則剛剛起步，近年來，工廠化食用菌產業在我國年均增速在12%～15%左右。
以全國工廠化金針菇數據為例，2003年，我國工廠化金針菇每日產量僅40噸；2010年，已上升至每日722噸；到2011年，這一數據攀升至841噸，8年來翻了20倍，呈現爆發性增長趨勢。與此同時，杏鮑菇從2005年日產4噸到2011年日產117噸，蟹味菇產量也同樣大幅增長，從2003年日產不足2噸達到2011年日產121噸。
從地區來看，2011年上海金針菇工廠化產量可達日產142噸，同比2010年增長63%；杏鮑菇工廠化產量日產19噸，蟹味菇日產56噸，分別比2010年增長36%和195%，走在國內食用菌工廠化產業發展的前列。
記者從工廠化食用菌生產企業獲悉，2010年，工廠化食用菌的平均毛利率在50%左右，并且根據相關稅法規定，工廠化食用菌生產企業從事農業項目的所得免征企業所得稅、自產自銷農業產品免征增值稅，企業幾乎沒有稅收負擔，故保證了較高的凈利潤率。
目前，食用菌工廠主要集中在上海、廣東、北京和河南等地。2007年開始，一些大型企業為了更大范圍銷售產品，同時為了降低成本，開始從一線大城市周邊向其他省市戰略性擴張，選擇資源優越，交通便利，投資政策更好的地區落戶。
