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          草菇泰國1號菌株交配型A因子分子遺傳學及生物信息學解析


          【發布日期】:2016-03-09
          【作者】 汪虹; 陳明杰; 馮愛萍; 譚琦; 鮑大鵬; 
           
          【Author】 WANG Hong;CHEN Mingjie;FENG Aiping;TAN Qi;BAO Dapeng;Institute of Edible Fungi,Shanghai Academy of Agricultural Sciences,Key Laboratory of Edible Fungi Resources and Utilization(South),Ministry of Agriculture,P.R.China;National Engineering Research Center of Edible Fungi,National R&D Center for Edible Fungi Processing,Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding of Shanghai;
           
          【機構】 上海市農業科學院食用菌研究所農業部南方食用菌資源利用重點實驗室國家食用菌工程技術研究中心國家食用菌加工技術研發分中心上海市農業遺傳育種重點開放實驗室; 
           
          【摘要】 采用簡并PCR引物獲得mip基因保守片段后,通過長片段PCR技術從草菇(Volvariella volvacea)菌株泰國1號孢子單核體中擴增獲得了A1、A2交配型位點的DNA序列,結果表明:每個交配型位點均含2個交配型基因(HD1和HD2),其中A1位點的交配型基因為HD1-A1-TG和HD2-A1-TG,長度分別為1341bp和1450bp,各編碼446和429個氨基酸殘基;A2位點的交配型基因為HD1-A2-TG和HD2-A2-TG,長度分別為1442bp和1501bp,各編碼463和443個氨基酸殘基。利用生物信息學方法分析了泰國1號及另外兩株草菇代表性菌株V23和屏優的交配型基因編碼的HD蛋白序列,結果表明:HD蛋白均含有同源異形結構域。根據系統進化樹可以看出,泰國1號與V23、屏優菌株A位點HD1和HD2基因序列所編碼的氨基酸序列之間親緣關系復雜,可能具有不同的起源。 
           
          【關鍵詞】 草菇; A交配型基因; 同源異形結構域蛋白; 
           
           
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