【作者】 陶永新； 黃千慧； 陳仁良； 謝斌； 連玲丹； 張磊； 丁宇斯； 江玉姬； 謝寶貴；
【Author】 TAO Yongxin;HUANG Qianhui;CHEN Renliang;XIE Bin;LIAN Lingdan;ZHANG Lei;DING Yusi;JIANG Yuji;XIE Baogui;College of Horticulture,Fujian Agriculture and Forestry University;Mycological Research Center,College of Life Sciences,Fujian Agriculture and Forestry University;College of Food Science,Fujian Agriculture and Forestry University;
【機構】 福建農林大學園藝學院； 福建農林大學生命科學學院菌物研究中心； 福建農林大學食品科學學院；
【摘要】 依據草菇(Volvariella volvacea)基因組和轉錄組數據,采用ZOOM軟件將轉錄組Reads定位到基因組的分析方法,從草菇中鑒定了一個多糖單加氧酶基因Vv-lpmo1,對其進行生物信息學分析,并對其高效誘導物進行篩選,采用定量PCR方法研究其在降解稻草時表達量的變化規律。結果表明:草菇Vv-lpmo1基因DNA序列長1432bp,有9個內含子,預測編碼305個氨基酸的蛋白質;生物信息學分析表明該蛋白質有分泌信號肽,且含有兩個完整的保守結構域:N端的glycoside hydrolase family 61(GH61)結構域和C端的cellulose-binding domain(CBD)結構域。通過對葡萄糖、無碳源(饑餓誘導)、微晶纖維素、濾紙、稻草和木屑6種不同基質誘導草菇菌絲的定量PCR,結果篩選出稻草對Vv-lpmo1基因有最強的誘導作用。進一步研究稻草誘導不同時間的變化過程中,該基因的表達規律為0~4h先下調;4~12h恢復到初始水平;12h以后開始迅速上調并維持較高水平。本研究表明草菇多糖單加氧酶基因Vv lpmo1屬于誘導表達型基因,可能在草菇降解稻草基質中起著重要作用。
【關鍵詞】 草菇； 多糖單加氧酶基因； 定量PCR； 表達量；